Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI5

Brsk1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brsk1Q5RJI5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brsk1Q5RJI5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brsk1Q5RJI5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brsk1Q5RJI5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brsk1Q5RJI5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brsk1Q5RJI5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brsk1Q5RJI5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Brsk1Q5RJI5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brsk1Q5RJI5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Brsk1Q5RJI5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brsk1Q5RJI5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brsk1Q5RJI5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brsk1Q5RJI5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brsk1Q5RJI5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brsk1Q5RJI5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brsk1Q5RJI5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brsk1Q5RJI5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brsk1Q5RJI5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brsk1Q5RJI5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brsk1Q5RJI5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brsk1Q5RJI5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brsk1Q5RJI5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brsk1Q5RJI5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Brsk1Q5RJI5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brsk1Q5RJI5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brsk1Q5RJI5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brsk1Q5RJI5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Brsk1Q5RJI5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brsk1Q5RJI5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brsk1Q5RJI5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brsk1Q5RJI5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Brsk1Q5RJI5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brsk1Q5RJI5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brsk1Q5RJI5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Brsk1Q5RJI5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brsk1Q5RJI5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brsk1Q5RJI5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brsk1Q5RJI5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brsk1Q5RJI5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brsk1Q5RJI5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brsk1Q5RJI5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brsk1Q5RJI5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brsk1Q5RJI5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brsk1Q5RJI5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brsk1Q5RJI5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brsk1Q5RJI5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brsk1Q5RJI5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brsk1Q5RJI5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brsk1Q5RJI5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brsk1Q5RJI5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brsk1Q5RJI5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brsk1Q5RJI5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Brsk1Q5RJI5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brsk1Q5RJI5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brsk1Q5RJI5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brsk1Q5RJI5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brsk1Q5RJI5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brsk1Q5RJI5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brsk1Q5RJI5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brsk1Q5RJI5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brsk1Q5RJI5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brsk1Q5RJI5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brsk1Q5RJI5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brsk1Q5RJI5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brsk1Q5RJI5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brsk1Q5RJI5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brsk1Q5RJI5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brsk1Q5RJI5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brsk1Q5RJI5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brsk1Q5RJI5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brsk1Q5RJI5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brsk1Q5RJI5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brsk1Q5RJI5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brsk1Q5RJI5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brsk1Q5RJI5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brsk1Q5RJI5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brsk1Q5RJI5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brsk1Q5RJI5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Brsk1Q5RJI5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brsk1Q5RJI5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brsk1Q5RJI5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brsk1Q5RJI5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brsk1Q5RJI5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brsk1Q5RJI5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brsk1Q5RJI5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brsk1Q5RJI5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Brsk1Q5RJI5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brsk1Q5RJI5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brsk1Q5RJI5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brsk1Q5RJI5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Brsk1Q5RJI5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Brsk1Q5RJI5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brsk1Q5RJI5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brsk1Q5RJI5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brsk1Q5RJI5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brsk1Q5RJI5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brsk1Q5RJI5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brsk1Q5RJI5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brsk1Q5RJI5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brsk1Q5RJI5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms