Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1B6

Trav8d-2, T cell receptor alpha variable 8D-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav8d-2Q5R1B6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trav8d-2Q5R1B6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trav8d-2Q5R1B6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Trav8d-2Q5R1B6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trav8d-2Q5R1B6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trav8d-2Q5R1B6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trav8d-2Q5R1B6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trav8d-2Q5R1B6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trav8d-2Q5R1B6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trav8d-2Q5R1B6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trav8d-2Q5R1B6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trav8d-2Q5R1B6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trav8d-2Q5R1B6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trav8d-2Q5R1B6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trav8d-2Q5R1B6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trav8d-2Q5R1B6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trav8d-2Q5R1B6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trav8d-2Q5R1B6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trav8d-2Q5R1B6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trav8d-2Q5R1B6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trav8d-2Q5R1B6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trav8d-2Q5R1B6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trav8d-2Q5R1B6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trav8d-2Q5R1B6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trav8d-2Q5R1B6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trav8d-2Q5R1B6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trav8d-2Q5R1B6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Trav8d-2Q5R1B6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trav8d-2Q5R1B6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Trav8d-2Q5R1B6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trav8d-2Q5R1B6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trav8d-2Q5R1B6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trav8d-2Q5R1B6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trav8d-2Q5R1B6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Trav8d-2Q5R1B6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trav8d-2Q5R1B6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trav8d-2Q5R1B6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trav8d-2Q5R1B6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Trav8d-2Q5R1B6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trav8d-2Q5R1B6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trav8d-2Q5R1B6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trav8d-2Q5R1B6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trav8d-2Q5R1B6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trav8d-2Q5R1B6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trav8d-2Q5R1B6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trav8d-2Q5R1B6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trav8d-2Q5R1B6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trav8d-2Q5R1B6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trav8d-2Q5R1B6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trav8d-2Q5R1B6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trav8d-2Q5R1B6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trav8d-2Q5R1B6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trav8d-2Q5R1B6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trav8d-2Q5R1B6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trav8d-2Q5R1B6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trav8d-2Q5R1B6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trav8d-2Q5R1B6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Trav8d-2Q5R1B6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trav8d-2Q5R1B6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trav8d-2Q5R1B6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trav8d-2Q5R1B6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trav8d-2Q5R1B6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trav8d-2Q5R1B6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trav8d-2Q5R1B6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trav8d-2Q5R1B6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Trav8d-2Q5R1B6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trav8d-2Q5R1B6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trav8d-2Q5R1B6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trav8d-2Q5R1B6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trav8d-2Q5R1B6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trav8d-2Q5R1B6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trav8d-2Q5R1B6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trav8d-2Q5R1B6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trav8d-2Q5R1B6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trav8d-2Q5R1B6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Trav8d-2Q5R1B6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trav8d-2Q5R1B6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trav8d-2Q5R1B6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trav8d-2Q5R1B6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trav8d-2Q5R1B6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trav8d-2Q5R1B6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trav8d-2Q5R1B6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trav8d-2Q5R1B6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trav8d-2Q5R1B6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trav8d-2Q5R1B6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trav8d-2Q5R1B6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trav8d-2Q5R1B6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trav8d-2Q5R1B6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trav8d-2Q5R1B6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trav8d-2Q5R1B6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trav8d-2Q5R1B6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trav8d-2Q5R1B6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trav8d-2Q5R1B6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trav8d-2Q5R1B6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trav8d-2Q5R1B6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trav8d-2Q5R1B6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trav8d-2Q5R1B6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Trav8d-2Q5R1B6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms