Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJS3

Fam20c, Extracellular serine/threonine protein kinase FAM20C, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20cQ5MJS3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam20cQ5MJS3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam20cQ5MJS3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Fam20cQ5MJS3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam20cQ5MJS3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam20cQ5MJS3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fam20cQ5MJS3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fam20cQ5MJS3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam20cQ5MJS3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam20cQ5MJS3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fam20cQ5MJS3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam20cQ5MJS3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Fam20cQ5MJS3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Fam20cQ5MJS3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam20cQ5MJS3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam20cQ5MJS3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam20cQ5MJS3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam20cQ5MJS3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fam20cQ5MJS3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fam20cQ5MJS3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam20cQ5MJS3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam20cQ5MJS3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam20cQ5MJS3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam20cQ5MJS3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam20cQ5MJS3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam20cQ5MJS3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam20cQ5MJS3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam20cQ5MJS3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam20cQ5MJS3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam20cQ5MJS3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam20cQ5MJS3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam20cQ5MJS3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam20cQ5MJS3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam20cQ5MJS3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam20cQ5MJS3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam20cQ5MJS3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam20cQ5MJS3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam20cQ5MJS3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam20cQ5MJS3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam20cQ5MJS3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam20cQ5MJS3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam20cQ5MJS3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam20cQ5MJS3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam20cQ5MJS3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam20cQ5MJS3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam20cQ5MJS3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam20cQ5MJS3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam20cQ5MJS3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam20cQ5MJS3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam20cQ5MJS3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam20cQ5MJS3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam20cQ5MJS3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam20cQ5MJS3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam20cQ5MJS3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam20cQ5MJS3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam20cQ5MJS3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam20cQ5MJS3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam20cQ5MJS3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam20cQ5MJS3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam20cQ5MJS3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam20cQ5MJS3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam20cQ5MJS3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam20cQ5MJS3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam20cQ5MJS3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam20cQ5MJS3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam20cQ5MJS3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam20cQ5MJS3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam20cQ5MJS3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam20cQ5MJS3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam20cQ5MJS3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam20cQ5MJS3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam20cQ5MJS3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam20cQ5MJS3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam20cQ5MJS3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam20cQ5MJS3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam20cQ5MJS3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam20cQ5MJS3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam20cQ5MJS3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam20cQ5MJS3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fam20cQ5MJS3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fam20cQ5MJS3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fam20cQ5MJS3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam20cQ5MJS3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam20cQ5MJS3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam20cQ5MJS3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam20cQ5MJS3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam20cQ5MJS3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam20cQ5MJS3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam20cQ5MJS3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam20cQ5MJS3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam20cQ5MJS3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam20cQ5MJS3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam20cQ5MJS3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam20cQ5MJS3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam20cQ5MJS3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam20cQ5MJS3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam20cQ5MJS3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam20cQ5MJS3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam20cQ5MJS3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam20cQ5MJS3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms