Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWC9

Gm3558, Predicted gene 3558, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3558Q5FWC9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3558Q5FWC9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3558Q5FWC9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3558Q5FWC9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3558Q5FWC9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3558Q5FWC9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3558Q5FWC9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3558Q5FWC9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3558Q5FWC9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3558Q5FWC9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3558Q5FWC9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3558Q5FWC9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3558Q5FWC9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3558Q5FWC9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3558Q5FWC9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3558Q5FWC9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3558Q5FWC9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3558Q5FWC9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3558Q5FWC9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3558Q5FWC9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3558Q5FWC9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3558Q5FWC9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3558Q5FWC9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3558Q5FWC9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3558Q5FWC9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3558Q5FWC9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm3558Q5FWC9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm3558Q5FWC9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm3558Q5FWC9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm3558Q5FWC9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3558Q5FWC9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3558Q5FWC9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3558Q5FWC9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3558Q5FWC9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3558Q5FWC9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3558Q5FWC9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3558Q5FWC9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3558Q5FWC9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3558Q5FWC9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3558Q5FWC9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3558Q5FWC9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3558Q5FWC9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3558Q5FWC9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3558Q5FWC9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3558Q5FWC9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3558Q5FWC9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3558Q5FWC9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3558Q5FWC9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3558Q5FWC9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3558Q5FWC9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3558Q5FWC9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3558Q5FWC9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3558Q5FWC9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3558Q5FWC9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3558Q5FWC9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3558Q5FWC9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3558Q5FWC9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3558Q5FWC9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3558Q5FWC9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3558Q5FWC9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3558Q5FWC9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm3558Q5FWC9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3558Q5FWC9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3558Q5FWC9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3558Q5FWC9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3558Q5FWC9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3558Q5FWC9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3558Q5FWC9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3558Q5FWC9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3558Q5FWC9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3558Q5FWC9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3558Q5FWC9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3558Q5FWC9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3558Q5FWC9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3558Q5FWC9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3558Q5FWC9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3558Q5FWC9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3558Q5FWC9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3558Q5FWC9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3558Q5FWC9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3558Q5FWC9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3558Q5FWC9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3558Q5FWC9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3558Q5FWC9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3558Q5FWC9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3558Q5FWC9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3558Q5FWC9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3558Q5FWC9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3558Q5FWC9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3558Q5FWC9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3558Q5FWC9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3558Q5FWC9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3558Q5FWC9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3558Q5FWC9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3558Q5FWC9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3558Q5FWC9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3558Q5FWC9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3558Q5FWC9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3558Q5FWC9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3558Q5FWC9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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