Protein–RNA interactions for Protein: Q569Z6

Thrap3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thrap3Q569Z6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Thrap3Q569Z6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Thrap3Q569Z6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Thrap3Q569Z6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Thrap3Q569Z6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Thrap3Q569Z6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Thrap3Q569Z6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Thrap3Q569Z6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Thrap3Q569Z6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Thrap3Q569Z6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Thrap3Q569Z6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Thrap3Q569Z6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Thrap3Q569Z6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Thrap3Q569Z6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Thrap3Q569Z6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Thrap3Q569Z6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Thrap3Q569Z6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Thrap3Q569Z6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Thrap3Q569Z6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Thrap3Q569Z6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Thrap3Q569Z6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Thrap3Q569Z6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Thrap3Q569Z6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Thrap3Q569Z6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Thrap3Q569Z6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Thrap3Q569Z6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Thrap3Q569Z6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Thrap3Q569Z6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Thrap3Q569Z6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Thrap3Q569Z6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Thrap3Q569Z6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Thrap3Q569Z6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Thrap3Q569Z6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Thrap3Q569Z6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Thrap3Q569Z6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Thrap3Q569Z6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Thrap3Q569Z6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Thrap3Q569Z6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Thrap3Q569Z6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Thrap3Q569Z6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Thrap3Q569Z6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Thrap3Q569Z6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Thrap3Q569Z6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Thrap3Q569Z6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Thrap3Q569Z6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Thrap3Q569Z6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Thrap3Q569Z6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Thrap3Q569Z6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Thrap3Q569Z6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Thrap3Q569Z6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Thrap3Q569Z6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Thrap3Q569Z6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Thrap3Q569Z6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Thrap3Q569Z6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Thrap3Q569Z6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Thrap3Q569Z6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Thrap3Q569Z6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Thrap3Q569Z6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Thrap3Q569Z6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Thrap3Q569Z6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Thrap3Q569Z6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Thrap3Q569Z6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Thrap3Q569Z6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Thrap3Q569Z6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Thrap3Q569Z6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Thrap3Q569Z6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Thrap3Q569Z6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Thrap3Q569Z6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Thrap3Q569Z6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Thrap3Q569Z6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Thrap3Q569Z6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Thrap3Q569Z6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Thrap3Q569Z6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Thrap3Q569Z6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Thrap3Q569Z6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Thrap3Q569Z6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Thrap3Q569Z6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Thrap3Q569Z6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Thrap3Q569Z6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Thrap3Q569Z6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Thrap3Q569Z6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Thrap3Q569Z6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Thrap3Q569Z6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Thrap3Q569Z6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Thrap3Q569Z6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Thrap3Q569Z6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Thrap3Q569Z6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Thrap3Q569Z6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Thrap3Q569Z6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Thrap3Q569Z6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Thrap3Q569Z6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Thrap3Q569Z6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Thrap3Q569Z6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Thrap3Q569Z6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Thrap3Q569Z6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Thrap3Q569Z6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Thrap3Q569Z6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Thrap3Q569Z6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Thrap3Q569Z6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Thrap3Q569Z6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms