Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,35■■□□□ 1,81
Ccdc84Q4VA36 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Ccdc84Q4VA36 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26,33■■□□□ 1,81
Ccdc84Q4VA36 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26,33■■□□□ 1,81
Ccdc84Q4VA36 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Ccdc84Q4VA36 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26,32■■□□□ 1,8
Ccdc84Q4VA36 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26,32■■□□□ 1,8
Ccdc84Q4VA36 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Ccdc84Q4VA36 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26,31■■□□□ 1,8
Ccdc84Q4VA36 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,31■■□□□ 1,8
Ccdc84Q4VA36 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Ccdc84Q4VA36 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26,3■■□□□ 1,8
Ccdc84Q4VA36 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26,3■■□□□ 1,8
Ccdc84Q4VA36 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Ccdc84Q4VA36 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Ccdc84Q4VA36 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Ccdc84Q4VA36 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26,29■■□□□ 1,8
Ccdc84Q4VA36 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Ccdc84Q4VA36 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Ccdc84Q4VA36 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Ccdc84Q4VA36 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Ccdc84Q4VA36 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,27■■□□□ 1,8
Ccdc84Q4VA36 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26,27■■□□□ 1,8
Ccdc84Q4VA36 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Ccdc84Q4VA36 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Ccdc84Q4VA36 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Ccdc84Q4VA36 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26,25■■□□□ 1,79
Ccdc84Q4VA36 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Ccdc84Q4VA36 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26,23■■□□□ 1,79
Ccdc84Q4VA36 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,22■■□□□ 1,79
Ccdc84Q4VA36 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Ccdc84Q4VA36 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26,22■■□□□ 1,79
Ccdc84Q4VA36 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Ccdc84Q4VA36 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Ccdc84Q4VA36 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Ccdc84Q4VA36 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Ccdc84Q4VA36 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26,2■■□□□ 1,78
Ccdc84Q4VA36 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26,2■■□□□ 1,78
Ccdc84Q4VA36 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Ccdc84Q4VA36 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Ccdc84Q4VA36 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26,19■■□□□ 1,78
Ccdc84Q4VA36 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26,19■■□□□ 1,78
Ccdc84Q4VA36 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Ccdc84Q4VA36 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26,19■■□□□ 1,78
Ccdc84Q4VA36 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26,19■■□□□ 1,78
Ccdc84Q4VA36 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Ccdc84Q4VA36 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Ccdc84Q4VA36 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Ccdc84Q4VA36 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Ccdc84Q4VA36 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26,18■■□□□ 1,78
Ccdc84Q4VA36 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26,18■■□□□ 1,78
Ccdc84Q4VA36 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Ccdc84Q4VA36 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Ccdc84Q4VA36 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,18■■□□□ 1,78
Ccdc84Q4VA36 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Ccdc84Q4VA36 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Ccdc84Q4VA36 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Ccdc84Q4VA36 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Ccdc84Q4VA36 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Ccdc84Q4VA36 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Ccdc84Q4VA36 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26,16■■□□□ 1,78
Ccdc84Q4VA36 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Ccdc84Q4VA36 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,15■■□□□ 1,78
Ccdc84Q4VA36 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Ccdc84Q4VA36 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Ccdc84Q4VA36 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26,14■■□□□ 1,78
Ccdc84Q4VA36 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26,14■■□□□ 1,78
Ccdc84Q4VA36 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,14■■□□□ 1,78
Ccdc84Q4VA36 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,77
Ccdc84Q4VA36 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,13■■□□□ 1,77
Ccdc84Q4VA36 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26,13■■□□□ 1,77
Ccdc84Q4VA36 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Ccdc84Q4VA36 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Ccdc84Q4VA36 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Ccdc84Q4VA36 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26,12■■□□□ 1,77
Ccdc84Q4VA36 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26,12■■□□□ 1,77
Ccdc84Q4VA36 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Ccdc84Q4VA36 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Ccdc84Q4VA36 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Ccdc84Q4VA36 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Ccdc84Q4VA36 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Ccdc84Q4VA36 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26,1■■□□□ 1,77
Ccdc84Q4VA36 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Ccdc84Q4VA36 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Ccdc84Q4VA36 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Ccdc84Q4VA36 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26,08■■□□□ 1,77
Ccdc84Q4VA36 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26,08■■□□□ 1,77
Ccdc84Q4VA36 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Ccdc84Q4VA36 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,07■■□□□ 1,76
Ccdc84Q4VA36 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,07■■□□□ 1,76
Ccdc84Q4VA36 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Ccdc84Q4VA36 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Ccdc84Q4VA36 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Ccdc84Q4VA36 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Ccdc84Q4VA36 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Ccdc84Q4VA36 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26,06■■□□□ 1,76
Ccdc84Q4VA36 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26,06■■□□□ 1,76
Ccdc84Q4VA36 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Ccdc84Q4VA36 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,04■■□□□ 1,76
Ccdc84Q4VA36 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26,04■■□□□ 1,76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,1 ms