Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL13

Gm527, Uncharacterized protein C14orf28 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm527Q4KL13 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm527Q4KL13 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm527Q4KL13 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm527Q4KL13 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm527Q4KL13 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm527Q4KL13 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm527Q4KL13 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm527Q4KL13 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm527Q4KL13 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm527Q4KL13 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm527Q4KL13 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm527Q4KL13 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm527Q4KL13 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm527Q4KL13 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm527Q4KL13 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm527Q4KL13 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm527Q4KL13 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm527Q4KL13 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm527Q4KL13 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm527Q4KL13 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm527Q4KL13 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm527Q4KL13 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm527Q4KL13 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm527Q4KL13 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm527Q4KL13 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm527Q4KL13 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm527Q4KL13 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm527Q4KL13 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm527Q4KL13 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm527Q4KL13 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm527Q4KL13 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm527Q4KL13 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm527Q4KL13 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm527Q4KL13 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm527Q4KL13 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm527Q4KL13 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm527Q4KL13 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm527Q4KL13 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm527Q4KL13 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm527Q4KL13 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm527Q4KL13 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm527Q4KL13 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm527Q4KL13 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm527Q4KL13 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm527Q4KL13 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm527Q4KL13 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm527Q4KL13 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm527Q4KL13 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm527Q4KL13 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm527Q4KL13 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm527Q4KL13 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm527Q4KL13 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm527Q4KL13 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm527Q4KL13 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm527Q4KL13 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm527Q4KL13 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm527Q4KL13 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm527Q4KL13 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm527Q4KL13 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm527Q4KL13 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm527Q4KL13 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm527Q4KL13 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm527Q4KL13 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm527Q4KL13 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm527Q4KL13 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm527Q4KL13 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm527Q4KL13 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm527Q4KL13 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm527Q4KL13 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm527Q4KL13 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm527Q4KL13 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm527Q4KL13 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm527Q4KL13 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm527Q4KL13 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm527Q4KL13 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm527Q4KL13 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm527Q4KL13 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm527Q4KL13 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm527Q4KL13 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm527Q4KL13 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm527Q4KL13 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm527Q4KL13 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm527Q4KL13 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm527Q4KL13 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm527Q4KL13 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm527Q4KL13 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm527Q4KL13 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm527Q4KL13 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm527Q4KL13 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm527Q4KL13 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm527Q4KL13 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm527Q4KL13 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm527Q4KL13 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm527Q4KL13 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm527Q4KL13 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm527Q4KL13 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm527Q4KL13 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm527Q4KL13 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm527Q4KL13 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm527Q4KL13 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms