Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmed1Q3V009 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmed1Q3V009 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmed1Q3V009 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmed1Q3V009 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmed1Q3V009 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmed1Q3V009 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmed1Q3V009 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmed1Q3V009 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmed1Q3V009 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmed1Q3V009 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmed1Q3V009 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmed1Q3V009 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmed1Q3V009 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmed1Q3V009 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmed1Q3V009 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmed1Q3V009 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmed1Q3V009 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmed1Q3V009 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmed1Q3V009 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmed1Q3V009 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmed1Q3V009 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmed1Q3V009 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmed1Q3V009 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmed1Q3V009 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmed1Q3V009 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmed1Q3V009 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmed1Q3V009 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmed1Q3V009 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmed1Q3V009 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmed1Q3V009 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmed1Q3V009 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmed1Q3V009 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmed1Q3V009 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmed1Q3V009 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmed1Q3V009 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmed1Q3V009 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmed1Q3V009 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmed1Q3V009 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmed1Q3V009 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmed1Q3V009 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmed1Q3V009 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmed1Q3V009 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmed1Q3V009 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmed1Q3V009 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmed1Q3V009 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmed1Q3V009 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmed1Q3V009 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmed1Q3V009 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmed1Q3V009 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmed1Q3V009 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmed1Q3V009 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmed1Q3V009 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmed1Q3V009 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmed1Q3V009 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmed1Q3V009 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmed1Q3V009 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmed1Q3V009 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmed1Q3V009 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmed1Q3V009 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmed1Q3V009 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmed1Q3V009 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmed1Q3V009 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmed1Q3V009 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmed1Q3V009 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmed1Q3V009 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmed1Q3V009 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmed1Q3V009 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmed1Q3V009 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmed1Q3V009 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmed1Q3V009 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmed1Q3V009 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmed1Q3V009 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmed1Q3V009 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmed1Q3V009 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmed1Q3V009 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmed1Q3V009 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmed1Q3V009 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmed1Q3V009 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmed1Q3V009 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmed1Q3V009 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmed1Q3V009 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmed1Q3V009 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmed1Q3V009 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmed1Q3V009 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmed1Q3V009 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmed1Q3V009 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmed1Q3V009 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmed1Q3V009 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmed1Q3V009 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmed1Q3V009 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmed1Q3V009 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmed1Q3V009 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmed1Q3V009 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmed1Q3V009 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmed1Q3V009 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmed1Q3V009 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmed1Q3V009 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmed1Q3V009 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmed1Q3V009 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.6 ms