Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pitpnm3Q3UHE1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pitpnm3Q3UHE1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pitpnm3Q3UHE1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pitpnm3Q3UHE1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pitpnm3Q3UHE1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pitpnm3Q3UHE1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pitpnm3Q3UHE1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pitpnm3Q3UHE1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pitpnm3Q3UHE1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pitpnm3Q3UHE1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pitpnm3Q3UHE1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pitpnm3Q3UHE1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pitpnm3Q3UHE1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pitpnm3Q3UHE1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pitpnm3Q3UHE1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pitpnm3Q3UHE1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pitpnm3Q3UHE1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pitpnm3Q3UHE1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pitpnm3Q3UHE1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pitpnm3Q3UHE1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pitpnm3Q3UHE1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pitpnm3Q3UHE1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pitpnm3Q3UHE1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pitpnm3Q3UHE1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pitpnm3Q3UHE1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pitpnm3Q3UHE1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pitpnm3Q3UHE1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pitpnm3Q3UHE1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pitpnm3Q3UHE1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pitpnm3Q3UHE1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pitpnm3Q3UHE1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pitpnm3Q3UHE1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pitpnm3Q3UHE1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pitpnm3Q3UHE1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pitpnm3Q3UHE1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pitpnm3Q3UHE1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pitpnm3Q3UHE1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pitpnm3Q3UHE1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pitpnm3Q3UHE1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pitpnm3Q3UHE1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pitpnm3Q3UHE1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pitpnm3Q3UHE1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pitpnm3Q3UHE1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pitpnm3Q3UHE1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pitpnm3Q3UHE1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pitpnm3Q3UHE1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pitpnm3Q3UHE1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pitpnm3Q3UHE1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pitpnm3Q3UHE1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pitpnm3Q3UHE1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pitpnm3Q3UHE1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pitpnm3Q3UHE1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pitpnm3Q3UHE1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pitpnm3Q3UHE1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pitpnm3Q3UHE1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pitpnm3Q3UHE1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pitpnm3Q3UHE1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pitpnm3Q3UHE1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pitpnm3Q3UHE1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pitpnm3Q3UHE1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pitpnm3Q3UHE1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pitpnm3Q3UHE1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pitpnm3Q3UHE1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pitpnm3Q3UHE1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pitpnm3Q3UHE1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pitpnm3Q3UHE1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pitpnm3Q3UHE1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pitpnm3Q3UHE1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pitpnm3Q3UHE1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pitpnm3Q3UHE1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pitpnm3Q3UHE1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pitpnm3Q3UHE1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pitpnm3Q3UHE1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pitpnm3Q3UHE1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pitpnm3Q3UHE1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pitpnm3Q3UHE1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pitpnm3Q3UHE1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pitpnm3Q3UHE1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pitpnm3Q3UHE1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pitpnm3Q3UHE1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pitpnm3Q3UHE1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pitpnm3Q3UHE1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pitpnm3Q3UHE1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pitpnm3Q3UHE1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pitpnm3Q3UHE1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pitpnm3Q3UHE1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pitpnm3Q3UHE1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pitpnm3Q3UHE1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pitpnm3Q3UHE1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pitpnm3Q3UHE1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pitpnm3Q3UHE1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pitpnm3Q3UHE1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pitpnm3Q3UHE1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pitpnm3Q3UHE1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pitpnm3Q3UHE1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pitpnm3Q3UHE1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms