Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGS4

Mcrip1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcrip1Q3UGS4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mcrip1Q3UGS4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Mcrip1Q3UGS4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mcrip1Q3UGS4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mcrip1Q3UGS4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mcrip1Q3UGS4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mcrip1Q3UGS4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mcrip1Q3UGS4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mcrip1Q3UGS4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mcrip1Q3UGS4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mcrip1Q3UGS4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mcrip1Q3UGS4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mcrip1Q3UGS4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mcrip1Q3UGS4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mcrip1Q3UGS4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mcrip1Q3UGS4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mcrip1Q3UGS4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mcrip1Q3UGS4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mcrip1Q3UGS4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mcrip1Q3UGS4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mcrip1Q3UGS4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mcrip1Q3UGS4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mcrip1Q3UGS4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mcrip1Q3UGS4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mcrip1Q3UGS4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mcrip1Q3UGS4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mcrip1Q3UGS4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mcrip1Q3UGS4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mcrip1Q3UGS4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mcrip1Q3UGS4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mcrip1Q3UGS4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mcrip1Q3UGS4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mcrip1Q3UGS4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mcrip1Q3UGS4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mcrip1Q3UGS4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mcrip1Q3UGS4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mcrip1Q3UGS4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mcrip1Q3UGS4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mcrip1Q3UGS4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mcrip1Q3UGS4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mcrip1Q3UGS4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mcrip1Q3UGS4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mcrip1Q3UGS4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mcrip1Q3UGS4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mcrip1Q3UGS4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mcrip1Q3UGS4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mcrip1Q3UGS4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mcrip1Q3UGS4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Mcrip1Q3UGS4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mcrip1Q3UGS4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mcrip1Q3UGS4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mcrip1Q3UGS4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mcrip1Q3UGS4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mcrip1Q3UGS4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mcrip1Q3UGS4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mcrip1Q3UGS4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mcrip1Q3UGS4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mcrip1Q3UGS4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mcrip1Q3UGS4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mcrip1Q3UGS4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mcrip1Q3UGS4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mcrip1Q3UGS4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mcrip1Q3UGS4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mcrip1Q3UGS4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mcrip1Q3UGS4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mcrip1Q3UGS4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mcrip1Q3UGS4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mcrip1Q3UGS4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mcrip1Q3UGS4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mcrip1Q3UGS4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mcrip1Q3UGS4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mcrip1Q3UGS4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mcrip1Q3UGS4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mcrip1Q3UGS4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mcrip1Q3UGS4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mcrip1Q3UGS4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mcrip1Q3UGS4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mcrip1Q3UGS4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mcrip1Q3UGS4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mcrip1Q3UGS4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mcrip1Q3UGS4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mcrip1Q3UGS4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mcrip1Q3UGS4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mcrip1Q3UGS4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mcrip1Q3UGS4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mcrip1Q3UGS4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mcrip1Q3UGS4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mcrip1Q3UGS4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mcrip1Q3UGS4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mcrip1Q3UGS4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mcrip1Q3UGS4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mcrip1Q3UGS4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mcrip1Q3UGS4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mcrip1Q3UGS4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Mcrip1Q3UGS4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Mcrip1Q3UGS4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Mcrip1Q3UGS4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mcrip1Q3UGS4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mcrip1Q3UGS4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mcrip1Q3UGS4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms