Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc9Q3U0M1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trappc9Q3U0M1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trappc9Q3U0M1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trappc9Q3U0M1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Trappc9Q3U0M1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trappc9Q3U0M1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trappc9Q3U0M1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trappc9Q3U0M1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trappc9Q3U0M1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc9Q3U0M1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc9Q3U0M1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc9Q3U0M1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc9Q3U0M1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc9Q3U0M1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc9Q3U0M1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc9Q3U0M1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc9Q3U0M1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc9Q3U0M1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc9Q3U0M1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc9Q3U0M1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc9Q3U0M1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc9Q3U0M1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc9Q3U0M1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trappc9Q3U0M1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trappc9Q3U0M1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trappc9Q3U0M1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trappc9Q3U0M1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trappc9Q3U0M1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trappc9Q3U0M1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc9Q3U0M1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc9Q3U0M1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc9Q3U0M1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc9Q3U0M1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc9Q3U0M1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc9Q3U0M1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc9Q3U0M1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trappc9Q3U0M1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trappc9Q3U0M1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trappc9Q3U0M1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc9Q3U0M1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc9Q3U0M1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc9Q3U0M1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc9Q3U0M1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc9Q3U0M1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc9Q3U0M1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc9Q3U0M1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc9Q3U0M1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc9Q3U0M1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc9Q3U0M1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc9Q3U0M1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc9Q3U0M1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc9Q3U0M1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc9Q3U0M1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc9Q3U0M1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trappc9Q3U0M1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trappc9Q3U0M1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc9Q3U0M1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc9Q3U0M1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc9Q3U0M1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc9Q3U0M1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc9Q3U0M1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc9Q3U0M1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc9Q3U0M1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc9Q3U0M1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc9Q3U0M1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc9Q3U0M1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc9Q3U0M1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc9Q3U0M1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc9Q3U0M1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc9Q3U0M1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc9Q3U0M1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc9Q3U0M1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc9Q3U0M1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc9Q3U0M1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc9Q3U0M1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc9Q3U0M1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc9Q3U0M1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc9Q3U0M1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc9Q3U0M1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trappc9Q3U0M1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trappc9Q3U0M1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trappc9Q3U0M1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trappc9Q3U0M1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trappc9Q3U0M1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trappc9Q3U0M1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trappc9Q3U0M1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trappc9Q3U0M1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trappc9Q3U0M1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trappc9Q3U0M1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc9Q3U0M1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc9Q3U0M1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc9Q3U0M1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc9Q3U0M1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc9Q3U0M1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc9Q3U0M1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trappc9Q3U0M1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trappc9Q3U0M1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Trappc9Q3U0M1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trappc9Q3U0M1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms