Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hhla1Q3TYV2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hhla1Q3TYV2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hhla1Q3TYV2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hhla1Q3TYV2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hhla1Q3TYV2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hhla1Q3TYV2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hhla1Q3TYV2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hhla1Q3TYV2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hhla1Q3TYV2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hhla1Q3TYV2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hhla1Q3TYV2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hhla1Q3TYV2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hhla1Q3TYV2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hhla1Q3TYV2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hhla1Q3TYV2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hhla1Q3TYV2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hhla1Q3TYV2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Hhla1Q3TYV2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Hhla1Q3TYV2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hhla1Q3TYV2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hhla1Q3TYV2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hhla1Q3TYV2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hhla1Q3TYV2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hhla1Q3TYV2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hhla1Q3TYV2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hhla1Q3TYV2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Hhla1Q3TYV2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hhla1Q3TYV2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hhla1Q3TYV2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hhla1Q3TYV2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hhla1Q3TYV2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hhla1Q3TYV2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hhla1Q3TYV2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hhla1Q3TYV2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hhla1Q3TYV2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hhla1Q3TYV2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hhla1Q3TYV2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hhla1Q3TYV2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hhla1Q3TYV2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hhla1Q3TYV2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hhla1Q3TYV2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hhla1Q3TYV2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hhla1Q3TYV2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hhla1Q3TYV2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hhla1Q3TYV2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hhla1Q3TYV2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hhla1Q3TYV2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hhla1Q3TYV2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hhla1Q3TYV2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hhla1Q3TYV2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hhla1Q3TYV2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hhla1Q3TYV2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hhla1Q3TYV2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Hhla1Q3TYV2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hhla1Q3TYV2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hhla1Q3TYV2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hhla1Q3TYV2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Hhla1Q3TYV2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hhla1Q3TYV2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hhla1Q3TYV2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hhla1Q3TYV2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hhla1Q3TYV2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hhla1Q3TYV2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hhla1Q3TYV2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hhla1Q3TYV2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hhla1Q3TYV2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hhla1Q3TYV2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hhla1Q3TYV2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hhla1Q3TYV2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hhla1Q3TYV2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hhla1Q3TYV2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Hhla1Q3TYV2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hhla1Q3TYV2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hhla1Q3TYV2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hhla1Q3TYV2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Hhla1Q3TYV2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Hhla1Q3TYV2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hhla1Q3TYV2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hhla1Q3TYV2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hhla1Q3TYV2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Hhla1Q3TYV2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hhla1Q3TYV2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hhla1Q3TYV2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Hhla1Q3TYV2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hhla1Q3TYV2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hhla1Q3TYV2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hhla1Q3TYV2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hhla1Q3TYV2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Hhla1Q3TYV2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hhla1Q3TYV2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hhla1Q3TYV2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hhla1Q3TYV2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hhla1Q3TYV2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hhla1Q3TYV2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hhla1Q3TYV2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hhla1Q3TYV2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hhla1Q3TYV2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hhla1Q3TYV2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hhla1Q3TYV2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.6 ms