Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TchpQ3TVW5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TchpQ3TVW5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TchpQ3TVW5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TchpQ3TVW5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TchpQ3TVW5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TchpQ3TVW5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TchpQ3TVW5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TchpQ3TVW5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TchpQ3TVW5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TchpQ3TVW5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TchpQ3TVW5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TchpQ3TVW5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TchpQ3TVW5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TchpQ3TVW5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TchpQ3TVW5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TchpQ3TVW5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TchpQ3TVW5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TchpQ3TVW5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TchpQ3TVW5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TchpQ3TVW5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TchpQ3TVW5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TchpQ3TVW5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TchpQ3TVW5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TchpQ3TVW5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TchpQ3TVW5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TchpQ3TVW5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TchpQ3TVW5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TchpQ3TVW5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TchpQ3TVW5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TchpQ3TVW5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TchpQ3TVW5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TchpQ3TVW5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TchpQ3TVW5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TchpQ3TVW5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TchpQ3TVW5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TchpQ3TVW5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TchpQ3TVW5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TchpQ3TVW5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TchpQ3TVW5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TchpQ3TVW5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TchpQ3TVW5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TchpQ3TVW5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TchpQ3TVW5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TchpQ3TVW5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TchpQ3TVW5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TchpQ3TVW5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TchpQ3TVW5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TchpQ3TVW5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TchpQ3TVW5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TchpQ3TVW5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TchpQ3TVW5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TchpQ3TVW5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TchpQ3TVW5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TchpQ3TVW5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TchpQ3TVW5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TchpQ3TVW5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TchpQ3TVW5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TchpQ3TVW5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TchpQ3TVW5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TchpQ3TVW5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TchpQ3TVW5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TchpQ3TVW5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TchpQ3TVW5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TchpQ3TVW5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TchpQ3TVW5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TchpQ3TVW5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TchpQ3TVW5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TchpQ3TVW5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TchpQ3TVW5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TchpQ3TVW5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TchpQ3TVW5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TchpQ3TVW5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TchpQ3TVW5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TchpQ3TVW5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TchpQ3TVW5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TchpQ3TVW5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TchpQ3TVW5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TchpQ3TVW5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TchpQ3TVW5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TchpQ3TVW5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TchpQ3TVW5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TchpQ3TVW5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TchpQ3TVW5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TchpQ3TVW5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TchpQ3TVW5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TchpQ3TVW5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TchpQ3TVW5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TchpQ3TVW5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TchpQ3TVW5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TchpQ3TVW5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TchpQ3TVW5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TchpQ3TVW5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TchpQ3TVW5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TchpQ3TVW5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TchpQ3TVW5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TchpQ3TVW5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TchpQ3TVW5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TchpQ3TVW5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TchpQ3TVW5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms