Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
Smarca4Q3TKT4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Smarca4Q3TKT4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Smarca4Q3TKT4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
Smarca4Q3TKT4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
Smarca4Q3TKT4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
Smarca4Q3TKT4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Smarca4Q3TKT4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
Smarca4Q3TKT4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
Smarca4Q3TKT4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Smarca4Q3TKT4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Smarca4Q3TKT4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Smarca4Q3TKT4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
Smarca4Q3TKT4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
Smarca4Q3TKT4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
Smarca4Q3TKT4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
Smarca4Q3TKT4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Smarca4Q3TKT4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC41.09■■■■■ 4.17
Smarca4Q3TKT4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Smarca4Q3TKT4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Smarca4Q3TKT4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC41.07■■■■■ 4.17
Smarca4Q3TKT4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.16
Smarca4Q3TKT4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
Smarca4Q3TKT4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
Smarca4Q3TKT4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.06■■■■■ 4.16
Smarca4Q3TKT4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
Smarca4Q3TKT4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
Smarca4Q3TKT4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
Smarca4Q3TKT4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Smarca4Q3TKT4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Smarca4Q3TKT4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Smarca4Q3TKT4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC41.03■■■■■ 4.16
Smarca4Q3TKT4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Smarca4Q3TKT4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Smarca4Q3TKT4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Smarca4Q3TKT4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
Smarca4Q3TKT4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC41■■■■■ 4.15
Smarca4Q3TKT4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
Smarca4Q3TKT4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
Smarca4Q3TKT4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
Smarca4Q3TKT4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
Smarca4Q3TKT4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
Smarca4Q3TKT4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Smarca4Q3TKT4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Smarca4Q3TKT4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC40.95■■■■■ 4.15
Smarca4Q3TKT4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
Smarca4Q3TKT4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
Smarca4Q3TKT4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
Smarca4Q3TKT4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Smarca4Q3TKT4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Smarca4Q3TKT4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
Smarca4Q3TKT4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
Smarca4Q3TKT4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
Smarca4Q3TKT4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
Smarca4Q3TKT4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
Smarca4Q3TKT4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC40.89■■■■■ 4.14
Smarca4Q3TKT4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC40.89■■■■■ 4.14
Smarca4Q3TKT4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.13
Smarca4Q3TKT4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
Smarca4Q3TKT4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
Smarca4Q3TKT4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
Smarca4Q3TKT4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
Smarca4Q3TKT4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC40.85■■■■■ 4.13
Smarca4Q3TKT4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Smarca4Q3TKT4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC40.83■■■■■ 4.13
Smarca4Q3TKT4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Smarca4Q3TKT4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
Smarca4Q3TKT4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
Smarca4Q3TKT4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
Smarca4Q3TKT4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
Smarca4Q3TKT4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
Smarca4Q3TKT4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
Smarca4Q3TKT4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
Smarca4Q3TKT4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
Smarca4Q3TKT4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
Smarca4Q3TKT4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
Smarca4Q3TKT4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
Smarca4Q3TKT4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
Smarca4Q3TKT4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
Smarca4Q3TKT4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
Smarca4Q3TKT4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.12
Smarca4Q3TKT4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC40.76■■■■■ 4.12
Smarca4Q3TKT4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
Smarca4Q3TKT4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
Smarca4Q3TKT4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
Smarca4Q3TKT4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
Smarca4Q3TKT4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
Smarca4Q3TKT4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
Smarca4Q3TKT4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC40.73■■■■■ 4.11
Smarca4Q3TKT4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC40.73■■■■■ 4.11
Smarca4Q3TKT4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC40.72■■■■■ 4.11
Smarca4Q3TKT4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
Smarca4Q3TKT4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
Smarca4Q3TKT4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
Smarca4Q3TKT4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
Smarca4Q3TKT4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
Smarca4Q3TKT4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
Smarca4Q3TKT4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
Smarca4Q3TKT4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
Smarca4Q3TKT4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC40.68■■■■■ 4.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms