Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR3

Nlrp4c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4cQ3TKR3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Nlrp4cQ3TKR3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nlrp4cQ3TKR3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nlrp4cQ3TKR3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nlrp4cQ3TKR3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nlrp4cQ3TKR3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nlrp4cQ3TKR3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nlrp4cQ3TKR3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlrp4cQ3TKR3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlrp4cQ3TKR3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlrp4cQ3TKR3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlrp4cQ3TKR3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlrp4cQ3TKR3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlrp4cQ3TKR3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nlrp4cQ3TKR3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nlrp4cQ3TKR3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nlrp4cQ3TKR3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlrp4cQ3TKR3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlrp4cQ3TKR3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlrp4cQ3TKR3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nlrp4cQ3TKR3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nlrp4cQ3TKR3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlrp4cQ3TKR3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlrp4cQ3TKR3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlrp4cQ3TKR3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlrp4cQ3TKR3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlrp4cQ3TKR3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nlrp4cQ3TKR3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nlrp4cQ3TKR3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nlrp4cQ3TKR3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlrp4cQ3TKR3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlrp4cQ3TKR3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlrp4cQ3TKR3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlrp4cQ3TKR3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlrp4cQ3TKR3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlrp4cQ3TKR3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlrp4cQ3TKR3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nlrp4cQ3TKR3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nlrp4cQ3TKR3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nlrp4cQ3TKR3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nlrp4cQ3TKR3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nlrp4cQ3TKR3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nlrp4cQ3TKR3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nlrp4cQ3TKR3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nlrp4cQ3TKR3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nlrp4cQ3TKR3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nlrp4cQ3TKR3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nlrp4cQ3TKR3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nlrp4cQ3TKR3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nlrp4cQ3TKR3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nlrp4cQ3TKR3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nlrp4cQ3TKR3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nlrp4cQ3TKR3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nlrp4cQ3TKR3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nlrp4cQ3TKR3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nlrp4cQ3TKR3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nlrp4cQ3TKR3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nlrp4cQ3TKR3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nlrp4cQ3TKR3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlrp4cQ3TKR3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlrp4cQ3TKR3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlrp4cQ3TKR3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlrp4cQ3TKR3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlrp4cQ3TKR3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nlrp4cQ3TKR3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nlrp4cQ3TKR3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nlrp4cQ3TKR3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nlrp4cQ3TKR3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nlrp4cQ3TKR3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nlrp4cQ3TKR3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nlrp4cQ3TKR3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nlrp4cQ3TKR3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nlrp4cQ3TKR3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nlrp4cQ3TKR3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nlrp4cQ3TKR3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nlrp4cQ3TKR3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nlrp4cQ3TKR3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nlrp4cQ3TKR3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nlrp4cQ3TKR3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nlrp4cQ3TKR3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nlrp4cQ3TKR3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nlrp4cQ3TKR3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nlrp4cQ3TKR3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nlrp4cQ3TKR3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nlrp4cQ3TKR3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Nlrp4cQ3TKR3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Nlrp4cQ3TKR3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nlrp4cQ3TKR3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nlrp4cQ3TKR3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nlrp4cQ3TKR3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nlrp4cQ3TKR3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nlrp4cQ3TKR3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nlrp4cQ3TKR3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nlrp4cQ3TKR3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nlrp4cQ3TKR3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nlrp4cQ3TKR3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Nlrp4cQ3TKR3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nlrp4cQ3TKR3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms