Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Jmjd8Q3TA59 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Jmjd8Q3TA59 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Jmjd8Q3TA59 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Jmjd8Q3TA59 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Jmjd8Q3TA59 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Jmjd8Q3TA59 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Jmjd8Q3TA59 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Jmjd8Q3TA59 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Jmjd8Q3TA59 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Jmjd8Q3TA59 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Jmjd8Q3TA59 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Jmjd8Q3TA59 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Jmjd8Q3TA59 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Jmjd8Q3TA59 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Jmjd8Q3TA59 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Jmjd8Q3TA59 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Jmjd8Q3TA59 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Jmjd8Q3TA59 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Jmjd8Q3TA59 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Jmjd8Q3TA59 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Jmjd8Q3TA59 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Jmjd8Q3TA59 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Jmjd8Q3TA59 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Jmjd8Q3TA59 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Jmjd8Q3TA59 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Jmjd8Q3TA59 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Jmjd8Q3TA59 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Jmjd8Q3TA59 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Jmjd8Q3TA59 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Jmjd8Q3TA59 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Jmjd8Q3TA59 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Jmjd8Q3TA59 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Jmjd8Q3TA59 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Jmjd8Q3TA59 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Jmjd8Q3TA59 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Jmjd8Q3TA59 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Jmjd8Q3TA59 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Jmjd8Q3TA59 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Jmjd8Q3TA59 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Jmjd8Q3TA59 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Jmjd8Q3TA59 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Jmjd8Q3TA59 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Jmjd8Q3TA59 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Jmjd8Q3TA59 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Jmjd8Q3TA59 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Jmjd8Q3TA59 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Jmjd8Q3TA59 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Jmjd8Q3TA59 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Jmjd8Q3TA59 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Jmjd8Q3TA59 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Jmjd8Q3TA59 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Jmjd8Q3TA59 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Jmjd8Q3TA59 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Jmjd8Q3TA59 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Jmjd8Q3TA59 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Jmjd8Q3TA59 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Jmjd8Q3TA59 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Jmjd8Q3TA59 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Jmjd8Q3TA59 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Jmjd8Q3TA59 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Jmjd8Q3TA59 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Jmjd8Q3TA59 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Jmjd8Q3TA59 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Jmjd8Q3TA59 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Jmjd8Q3TA59 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Jmjd8Q3TA59 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Jmjd8Q3TA59 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Jmjd8Q3TA59 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Jmjd8Q3TA59 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Jmjd8Q3TA59 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Jmjd8Q3TA59 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Jmjd8Q3TA59 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Jmjd8Q3TA59 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Jmjd8Q3TA59 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Jmjd8Q3TA59 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Jmjd8Q3TA59 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Jmjd8Q3TA59 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Jmjd8Q3TA59 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Jmjd8Q3TA59 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Jmjd8Q3TA59 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Jmjd8Q3TA59 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Jmjd8Q3TA59 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Jmjd8Q3TA59 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Jmjd8Q3TA59 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Jmjd8Q3TA59 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Jmjd8Q3TA59 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Jmjd8Q3TA59 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Jmjd8Q3TA59 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Jmjd8Q3TA59 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Jmjd8Q3TA59 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Jmjd8Q3TA59 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Jmjd8Q3TA59 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Jmjd8Q3TA59 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Jmjd8Q3TA59 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Jmjd8Q3TA59 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Jmjd8Q3TA59 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Jmjd8Q3TA59 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Jmjd8Q3TA59 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Jmjd8Q3TA59 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.7 ms