Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccbe1Q3MI99 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccbe1Q3MI99 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccbe1Q3MI99 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccbe1Q3MI99 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccbe1Q3MI99 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccbe1Q3MI99 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccbe1Q3MI99 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccbe1Q3MI99 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccbe1Q3MI99 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccbe1Q3MI99 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccbe1Q3MI99 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccbe1Q3MI99 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccbe1Q3MI99 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccbe1Q3MI99 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccbe1Q3MI99 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccbe1Q3MI99 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccbe1Q3MI99 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccbe1Q3MI99 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccbe1Q3MI99 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccbe1Q3MI99 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccbe1Q3MI99 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccbe1Q3MI99 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccbe1Q3MI99 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccbe1Q3MI99 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccbe1Q3MI99 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccbe1Q3MI99 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccbe1Q3MI99 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccbe1Q3MI99 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccbe1Q3MI99 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccbe1Q3MI99 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccbe1Q3MI99 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccbe1Q3MI99 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccbe1Q3MI99 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccbe1Q3MI99 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccbe1Q3MI99 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccbe1Q3MI99 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccbe1Q3MI99 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccbe1Q3MI99 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccbe1Q3MI99 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccbe1Q3MI99 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccbe1Q3MI99 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccbe1Q3MI99 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccbe1Q3MI99 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccbe1Q3MI99 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccbe1Q3MI99 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccbe1Q3MI99 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccbe1Q3MI99 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccbe1Q3MI99 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccbe1Q3MI99 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccbe1Q3MI99 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccbe1Q3MI99 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccbe1Q3MI99 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccbe1Q3MI99 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccbe1Q3MI99 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccbe1Q3MI99 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccbe1Q3MI99 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccbe1Q3MI99 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccbe1Q3MI99 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccbe1Q3MI99 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccbe1Q3MI99 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccbe1Q3MI99 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccbe1Q3MI99 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccbe1Q3MI99 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccbe1Q3MI99 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccbe1Q3MI99 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccbe1Q3MI99 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccbe1Q3MI99 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccbe1Q3MI99 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccbe1Q3MI99 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccbe1Q3MI99 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccbe1Q3MI99 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccbe1Q3MI99 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccbe1Q3MI99 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccbe1Q3MI99 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccbe1Q3MI99 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccbe1Q3MI99 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccbe1Q3MI99 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccbe1Q3MI99 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccbe1Q3MI99 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccbe1Q3MI99 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccbe1Q3MI99 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccbe1Q3MI99 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccbe1Q3MI99 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccbe1Q3MI99 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccbe1Q3MI99 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccbe1Q3MI99 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccbe1Q3MI99 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccbe1Q3MI99 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccbe1Q3MI99 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccbe1Q3MI99 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccbe1Q3MI99 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccbe1Q3MI99 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccbe1Q3MI99 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccbe1Q3MI99 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccbe1Q3MI99 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccbe1Q3MI99 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccbe1Q3MI99 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccbe1Q3MI99 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccbe1Q3MI99 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms