Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Col24a1Q30D77 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Col24a1Q30D77 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Col24a1Q30D77 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Col24a1Q30D77 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Col24a1Q30D77 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Col24a1Q30D77 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Col24a1Q30D77 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Col24a1Q30D77 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Col24a1Q30D77 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Col24a1Q30D77 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Col24a1Q30D77 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Col24a1Q30D77 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Col24a1Q30D77 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Col24a1Q30D77 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Col24a1Q30D77 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Col24a1Q30D77 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Col24a1Q30D77 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Col24a1Q30D77 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Col24a1Q30D77 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Col24a1Q30D77 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Col24a1Q30D77 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Col24a1Q30D77 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Col24a1Q30D77 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Col24a1Q30D77 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Col24a1Q30D77 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Col24a1Q30D77 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Col24a1Q30D77 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Col24a1Q30D77 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Col24a1Q30D77 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Col24a1Q30D77 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Col24a1Q30D77 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Col24a1Q30D77 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Col24a1Q30D77 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Col24a1Q30D77 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Col24a1Q30D77 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col24a1Q30D77 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col24a1Q30D77 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Col24a1Q30D77 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Col24a1Q30D77 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Col24a1Q30D77 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Col24a1Q30D77 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Col24a1Q30D77 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Col24a1Q30D77 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Col24a1Q30D77 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Col24a1Q30D77 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Col24a1Q30D77 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Col24a1Q30D77 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Col24a1Q30D77 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Col24a1Q30D77 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Col24a1Q30D77 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Col24a1Q30D77 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Col24a1Q30D77 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Col24a1Q30D77 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Col24a1Q30D77 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Col24a1Q30D77 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Col24a1Q30D77 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Col24a1Q30D77 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Col24a1Q30D77 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Col24a1Q30D77 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Col24a1Q30D77 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Col24a1Q30D77 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Col24a1Q30D77 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Col24a1Q30D77 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Col24a1Q30D77 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Col24a1Q30D77 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
Col24a1Q30D77 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Col24a1Q30D77 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Col24a1Q30D77 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Col24a1Q30D77 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Col24a1Q30D77 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Col24a1Q30D77 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Col24a1Q30D77 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Col24a1Q30D77 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col24a1Q30D77 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col24a1Q30D77 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col24a1Q30D77 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col24a1Q30D77 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Col24a1Q30D77 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Col24a1Q30D77 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Col24a1Q30D77 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Col24a1Q30D77 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Col24a1Q30D77 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col24a1Q30D77 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col24a1Q30D77 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col24a1Q30D77 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col24a1Q30D77 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col24a1Q30D77 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col24a1Q30D77 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col24a1Q30D77 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col24a1Q30D77 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Col24a1Q30D77 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Col24a1Q30D77 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Col24a1Q30D77 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Col24a1Q30D77 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Col24a1Q30D77 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Col24a1Q30D77 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Col24a1Q30D77 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Col24a1Q30D77 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Col24a1Q30D77 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms