Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLK6

B3gnt4, N-acetyllactosaminide beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3gnt4Q1RLK6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
B3gnt4Q1RLK6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
B3gnt4Q1RLK6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
B3gnt4Q1RLK6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
B3gnt4Q1RLK6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
B3gnt4Q1RLK6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
B3gnt4Q1RLK6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
B3gnt4Q1RLK6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
B3gnt4Q1RLK6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
B3gnt4Q1RLK6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
B3gnt4Q1RLK6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
B3gnt4Q1RLK6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
B3gnt4Q1RLK6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
B3gnt4Q1RLK6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
B3gnt4Q1RLK6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
B3gnt4Q1RLK6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
B3gnt4Q1RLK6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
B3gnt4Q1RLK6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
B3gnt4Q1RLK6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
B3gnt4Q1RLK6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
B3gnt4Q1RLK6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
B3gnt4Q1RLK6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
B3gnt4Q1RLK6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
B3gnt4Q1RLK6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
B3gnt4Q1RLK6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
B3gnt4Q1RLK6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
B3gnt4Q1RLK6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
B3gnt4Q1RLK6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
B3gnt4Q1RLK6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
B3gnt4Q1RLK6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
B3gnt4Q1RLK6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
B3gnt4Q1RLK6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
B3gnt4Q1RLK6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
B3gnt4Q1RLK6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
B3gnt4Q1RLK6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
B3gnt4Q1RLK6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
B3gnt4Q1RLK6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
B3gnt4Q1RLK6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
B3gnt4Q1RLK6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
B3gnt4Q1RLK6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
B3gnt4Q1RLK6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
B3gnt4Q1RLK6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
B3gnt4Q1RLK6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
B3gnt4Q1RLK6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
B3gnt4Q1RLK6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
B3gnt4Q1RLK6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
B3gnt4Q1RLK6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
B3gnt4Q1RLK6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
B3gnt4Q1RLK6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
B3gnt4Q1RLK6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
B3gnt4Q1RLK6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
B3gnt4Q1RLK6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
B3gnt4Q1RLK6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
B3gnt4Q1RLK6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
B3gnt4Q1RLK6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
B3gnt4Q1RLK6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
B3gnt4Q1RLK6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
B3gnt4Q1RLK6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
B3gnt4Q1RLK6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
B3gnt4Q1RLK6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
B3gnt4Q1RLK6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B3gnt4Q1RLK6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B3gnt4Q1RLK6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B3gnt4Q1RLK6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
B3gnt4Q1RLK6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
B3gnt4Q1RLK6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
B3gnt4Q1RLK6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
B3gnt4Q1RLK6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
B3gnt4Q1RLK6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
B3gnt4Q1RLK6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
B3gnt4Q1RLK6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B3gnt4Q1RLK6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B3gnt4Q1RLK6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B3gnt4Q1RLK6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B3gnt4Q1RLK6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
B3gnt4Q1RLK6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
B3gnt4Q1RLK6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
B3gnt4Q1RLK6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
B3gnt4Q1RLK6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B3gnt4Q1RLK6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B3gnt4Q1RLK6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B3gnt4Q1RLK6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B3gnt4Q1RLK6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B3gnt4Q1RLK6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B3gnt4Q1RLK6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
B3gnt4Q1RLK6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
B3gnt4Q1RLK6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
B3gnt4Q1RLK6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
B3gnt4Q1RLK6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
B3gnt4Q1RLK6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
B3gnt4Q1RLK6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
B3gnt4Q1RLK6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
B3gnt4Q1RLK6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
B3gnt4Q1RLK6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
B3gnt4Q1RLK6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
B3gnt4Q1RLK6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
B3gnt4Q1RLK6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
B3gnt4Q1RLK6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
B3gnt4Q1RLK6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
B3gnt4Q1RLK6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms