Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cers3Q1A3B0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cers3Q1A3B0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Cers3Q1A3B0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cers3Q1A3B0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cers3Q1A3B0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cers3Q1A3B0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cers3Q1A3B0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cers3Q1A3B0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cers3Q1A3B0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cers3Q1A3B0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cers3Q1A3B0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cers3Q1A3B0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cers3Q1A3B0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cers3Q1A3B0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cers3Q1A3B0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cers3Q1A3B0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cers3Q1A3B0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cers3Q1A3B0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cers3Q1A3B0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cers3Q1A3B0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cers3Q1A3B0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cers3Q1A3B0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cers3Q1A3B0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cers3Q1A3B0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cers3Q1A3B0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cers3Q1A3B0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Cers3Q1A3B0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cers3Q1A3B0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Cers3Q1A3B0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Cers3Q1A3B0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cers3Q1A3B0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cers3Q1A3B0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cers3Q1A3B0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cers3Q1A3B0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cers3Q1A3B0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cers3Q1A3B0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cers3Q1A3B0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cers3Q1A3B0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cers3Q1A3B0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cers3Q1A3B0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cers3Q1A3B0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cers3Q1A3B0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cers3Q1A3B0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cers3Q1A3B0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cers3Q1A3B0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cers3Q1A3B0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cers3Q1A3B0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Cers3Q1A3B0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cers3Q1A3B0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cers3Q1A3B0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cers3Q1A3B0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cers3Q1A3B0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cers3Q1A3B0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cers3Q1A3B0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Cers3Q1A3B0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cers3Q1A3B0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cers3Q1A3B0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cers3Q1A3B0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cers3Q1A3B0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cers3Q1A3B0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Cers3Q1A3B0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cers3Q1A3B0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cers3Q1A3B0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cers3Q1A3B0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cers3Q1A3B0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cers3Q1A3B0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cers3Q1A3B0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cers3Q1A3B0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Cers3Q1A3B0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cers3Q1A3B0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cers3Q1A3B0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cers3Q1A3B0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cers3Q1A3B0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cers3Q1A3B0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cers3Q1A3B0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cers3Q1A3B0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cers3Q1A3B0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cers3Q1A3B0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cers3Q1A3B0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cers3Q1A3B0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cers3Q1A3B0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cers3Q1A3B0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cers3Q1A3B0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cers3Q1A3B0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cers3Q1A3B0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cers3Q1A3B0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cers3Q1A3B0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cers3Q1A3B0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cers3Q1A3B0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cers3Q1A3B0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cers3Q1A3B0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cers3Q1A3B0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Cers3Q1A3B0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cers3Q1A3B0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cers3Q1A3B0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cers3Q1A3B0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Cers3Q1A3B0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cers3Q1A3B0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cers3Q1A3B0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
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