Protein–RNA interactions for Protein: Q14AX6

Cdk12, Cyclin-dependent kinase 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk12Q14AX6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Cdk12Q14AX6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Cdk12Q14AX6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Cdk12Q14AX6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Cdk12Q14AX6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Cdk12Q14AX6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Cdk12Q14AX6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Cdk12Q14AX6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Cdk12Q14AX6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Cdk12Q14AX6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Cdk12Q14AX6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Cdk12Q14AX6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Cdk12Q14AX6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Cdk12Q14AX6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Cdk12Q14AX6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Cdk12Q14AX6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Cdk12Q14AX6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Cdk12Q14AX6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Cdk12Q14AX6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Cdk12Q14AX6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Cdk12Q14AX6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Cdk12Q14AX6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Cdk12Q14AX6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Cdk12Q14AX6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Cdk12Q14AX6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Cdk12Q14AX6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Cdk12Q14AX6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Cdk12Q14AX6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Cdk12Q14AX6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Cdk12Q14AX6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Cdk12Q14AX6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Cdk12Q14AX6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Cdk12Q14AX6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Cdk12Q14AX6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Cdk12Q14AX6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Cdk12Q14AX6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Cdk12Q14AX6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Cdk12Q14AX6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Cdk12Q14AX6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Cdk12Q14AX6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Cdk12Q14AX6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Cdk12Q14AX6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cdk12Q14AX6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cdk12Q14AX6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Cdk12Q14AX6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Cdk12Q14AX6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Cdk12Q14AX6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Cdk12Q14AX6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Cdk12Q14AX6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Cdk12Q14AX6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Cdk12Q14AX6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Cdk12Q14AX6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Cdk12Q14AX6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cdk12Q14AX6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cdk12Q14AX6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cdk12Q14AX6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cdk12Q14AX6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Cdk12Q14AX6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cdk12Q14AX6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cdk12Q14AX6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cdk12Q14AX6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cdk12Q14AX6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Cdk12Q14AX6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Cdk12Q14AX6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Cdk12Q14AX6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Cdk12Q14AX6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Cdk12Q14AX6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Cdk12Q14AX6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cdk12Q14AX6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cdk12Q14AX6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cdk12Q14AX6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cdk12Q14AX6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cdk12Q14AX6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cdk12Q14AX6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cdk12Q14AX6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Cdk12Q14AX6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Cdk12Q14AX6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Cdk12Q14AX6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Cdk12Q14AX6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Cdk12Q14AX6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cdk12Q14AX6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cdk12Q14AX6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cdk12Q14AX6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cdk12Q14AX6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cdk12Q14AX6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cdk12Q14AX6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Cdk12Q14AX6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Cdk12Q14AX6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Cdk12Q14AX6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Cdk12Q14AX6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Cdk12Q14AX6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Cdk12Q14AX6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Cdk12Q14AX6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cdk12Q14AX6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cdk12Q14AX6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cdk12Q14AX6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Cdk12Q14AX6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Cdk12Q14AX6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cdk12Q14AX6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cdk12Q14AX6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms