Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rpusd3Q14AI6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rpusd3Q14AI6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rpusd3Q14AI6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rpusd3Q14AI6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rpusd3Q14AI6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rpusd3Q14AI6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpusd3Q14AI6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpusd3Q14AI6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpusd3Q14AI6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpusd3Q14AI6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpusd3Q14AI6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpusd3Q14AI6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpusd3Q14AI6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpusd3Q14AI6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpusd3Q14AI6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpusd3Q14AI6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpusd3Q14AI6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpusd3Q14AI6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpusd3Q14AI6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpusd3Q14AI6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpusd3Q14AI6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpusd3Q14AI6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpusd3Q14AI6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpusd3Q14AI6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpusd3Q14AI6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpusd3Q14AI6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpusd3Q14AI6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpusd3Q14AI6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpusd3Q14AI6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpusd3Q14AI6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpusd3Q14AI6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpusd3Q14AI6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpusd3Q14AI6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpusd3Q14AI6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpusd3Q14AI6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpusd3Q14AI6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpusd3Q14AI6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpusd3Q14AI6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpusd3Q14AI6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpusd3Q14AI6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpusd3Q14AI6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpusd3Q14AI6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rpusd3Q14AI6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rpusd3Q14AI6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rpusd3Q14AI6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rpusd3Q14AI6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rpusd3Q14AI6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rpusd3Q14AI6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rpusd3Q14AI6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rpusd3Q14AI6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rpusd3Q14AI6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rpusd3Q14AI6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rpusd3Q14AI6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rpusd3Q14AI6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rpusd3Q14AI6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rpusd3Q14AI6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rpusd3Q14AI6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rpusd3Q14AI6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rpusd3Q14AI6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rpusd3Q14AI6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rpusd3Q14AI6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rpusd3Q14AI6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rpusd3Q14AI6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rpusd3Q14AI6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rpusd3Q14AI6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rpusd3Q14AI6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rpusd3Q14AI6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rpusd3Q14AI6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rpusd3Q14AI6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rpusd3Q14AI6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rpusd3Q14AI6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rpusd3Q14AI6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rpusd3Q14AI6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rpusd3Q14AI6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rpusd3Q14AI6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Rpusd3Q14AI6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rpusd3Q14AI6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rpusd3Q14AI6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rpusd3Q14AI6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rpusd3Q14AI6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rpusd3Q14AI6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rpusd3Q14AI6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rpusd3Q14AI6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rpusd3Q14AI6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpusd3Q14AI6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpusd3Q14AI6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpusd3Q14AI6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpusd3Q14AI6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpusd3Q14AI6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpusd3Q14AI6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpusd3Q14AI6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpusd3Q14AI6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpusd3Q14AI6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpusd3Q14AI6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpusd3Q14AI6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpusd3Q14AI6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpusd3Q14AI6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpusd3Q14AI6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpusd3Q14AI6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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