Protein–RNA interactions for Protein: Q0VB07

Pglyrp4, Peptidoglycan recognition protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pglyrp4Q0VB07 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,53■□□□□ 0,08
Pglyrp4Q0VB07 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,53■□□□□ 0,08
Pglyrp4Q0VB07 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,53■□□□□ 0,08
Pglyrp4Q0VB07 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,53■□□□□ 0,08
Pglyrp4Q0VB07 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15,53■□□□□ 0,08
Pglyrp4Q0VB07 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15,53■□□□□ 0,08
Pglyrp4Q0VB07 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,53■□□□□ 0,08
Pglyrp4Q0VB07 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,52■□□□□ 0,08
Pglyrp4Q0VB07 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,52■□□□□ 0,08
Pglyrp4Q0VB07 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15,52■□□□□ 0,08
Pglyrp4Q0VB07 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15,52■□□□□ 0,08
Pglyrp4Q0VB07 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15,52■□□□□ 0,08
Pglyrp4Q0VB07 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,52■□□□□ 0,07
Pglyrp4Q0VB07 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,52■□□□□ 0,07
Pglyrp4Q0VB07 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15,52■□□□□ 0,07
Pglyrp4Q0VB07 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,52■□□□□ 0,07
Pglyrp4Q0VB07 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15,51■□□□□ 0,07
Pglyrp4Q0VB07 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15,51■□□□□ 0,07
Pglyrp4Q0VB07 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15,51■□□□□ 0,07
Pglyrp4Q0VB07 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,5■□□□□ 0,07
Pglyrp4Q0VB07 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,5■□□□□ 0,07
Pglyrp4Q0VB07 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,5■□□□□ 0,07
Pglyrp4Q0VB07 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,5■□□□□ 0,07
Pglyrp4Q0VB07 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,5■□□□□ 0,07
Pglyrp4Q0VB07 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,48■□□□□ 0,07
Pglyrp4Q0VB07 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15,48■□□□□ 0,07
Pglyrp4Q0VB07 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,48■□□□□ 0,07
Pglyrp4Q0VB07 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,48■□□□□ 0,07
Pglyrp4Q0VB07 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,48■□□□□ 0,07
Pglyrp4Q0VB07 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15,48■□□□□ 0,07
Pglyrp4Q0VB07 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15,48■□□□□ 0,07
Pglyrp4Q0VB07 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15,47■□□□□ 0,07
Pglyrp4Q0VB07 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC15,47■□□□□ 0,07
Pglyrp4Q0VB07 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15,47■□□□□ 0,07
Pglyrp4Q0VB07 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,47■□□□□ 0,07
Pglyrp4Q0VB07 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,46■□□□□ 0,07
Pglyrp4Q0VB07 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,46■□□□□ 0,07
Pglyrp4Q0VB07 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15,46■□□□□ 0,07
Pglyrp4Q0VB07 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15,46■□□□□ 0,07
Pglyrp4Q0VB07 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC15,46■□□□□ 0,07
Pglyrp4Q0VB07 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15,46■□□□□ 0,07
Pglyrp4Q0VB07 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,46■□□□□ 0,06
Pglyrp4Q0VB07 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,45■□□□□ 0,06
Pglyrp4Q0VB07 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,45■□□□□ 0,06
Pglyrp4Q0VB07 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,45■□□□□ 0,06
Pglyrp4Q0VB07 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,44■□□□□ 0,06
Pglyrp4Q0VB07 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,44■□□□□ 0,06
Pglyrp4Q0VB07 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15,44■□□□□ 0,06
Pglyrp4Q0VB07 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15,44■□□□□ 0,06
Pglyrp4Q0VB07 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15,43■□□□□ 0,06
Pglyrp4Q0VB07 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,43■□□□□ 0,06
Pglyrp4Q0VB07 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,43■□□□□ 0,06
Pglyrp4Q0VB07 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,43■□□□□ 0,06
Pglyrp4Q0VB07 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,43■□□□□ 0,06
Pglyrp4Q0VB07 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,43■□□□□ 0,06
Pglyrp4Q0VB07 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,43■□□□□ 0,06
Pglyrp4Q0VB07 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,43■□□□□ 0,06
Pglyrp4Q0VB07 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,43■□□□□ 0,06
Pglyrp4Q0VB07 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,43■□□□□ 0,06
Pglyrp4Q0VB07 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,43■□□□□ 0,06
Pglyrp4Q0VB07 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,43■□□□□ 0,06
Pglyrp4Q0VB07 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,42■□□□□ 0,06
Pglyrp4Q0VB07 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,42■□□□□ 0,06
Pglyrp4Q0VB07 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,42■□□□□ 0,06
Pglyrp4Q0VB07 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,42■□□□□ 0,06
Pglyrp4Q0VB07 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,42■□□□□ 0,06
Pglyrp4Q0VB07 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,42■□□□□ 0,06
Pglyrp4Q0VB07 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,42■□□□□ 0,06
Pglyrp4Q0VB07 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15,42■□□□□ 0,06
Pglyrp4Q0VB07 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,42■□□□□ 0,06
Pglyrp4Q0VB07 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,42■□□□□ 0,06
Pglyrp4Q0VB07 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,42■□□□□ 0,06
Pglyrp4Q0VB07 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,42■□□□□ 0,06
Pglyrp4Q0VB07 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,41■□□□□ 0,06
Pglyrp4Q0VB07 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,41■□□□□ 0,06
Pglyrp4Q0VB07 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC15,41■□□□□ 0,06
Pglyrp4Q0VB07 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC15,41■□□□□ 0,06
Pglyrp4Q0VB07 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15,41■□□□□ 0,06
Pglyrp4Q0VB07 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,4■□□□□ 0,06
Pglyrp4Q0VB07 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,4■□□□□ 0,06
Pglyrp4Q0VB07 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15,4■□□□□ 0,06
Pglyrp4Q0VB07 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,4■□□□□ 0,06
Pglyrp4Q0VB07 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,4■□□□□ 0,06
Pglyrp4Q0VB07 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,4■□□□□ 0,06
Pglyrp4Q0VB07 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,4■□□□□ 0,06
Pglyrp4Q0VB07 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15,4■□□□□ 0,06
Pglyrp4Q0VB07 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,4■□□□□ 0,06
Pglyrp4Q0VB07 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,39■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,39■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15,39■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC15,39■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,39■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,39■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15,39■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,39■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,38■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15,38■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC15,38■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15,38■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,38■□□□□ 0,05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,9 ms