Protein–RNA interactions for Protein: Q08EJ0

Plac8l1, PLAC8-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plac8l1Q08EJ0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plac8l1Q08EJ0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plac8l1Q08EJ0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plac8l1Q08EJ0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Plac8l1Q08EJ0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plac8l1Q08EJ0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plac8l1Q08EJ0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plac8l1Q08EJ0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Plac8l1Q08EJ0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plac8l1Q08EJ0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plac8l1Q08EJ0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plac8l1Q08EJ0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plac8l1Q08EJ0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plac8l1Q08EJ0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plac8l1Q08EJ0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plac8l1Q08EJ0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plac8l1Q08EJ0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plac8l1Q08EJ0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plac8l1Q08EJ0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plac8l1Q08EJ0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plac8l1Q08EJ0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plac8l1Q08EJ0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plac8l1Q08EJ0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plac8l1Q08EJ0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plac8l1Q08EJ0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plac8l1Q08EJ0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plac8l1Q08EJ0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plac8l1Q08EJ0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plac8l1Q08EJ0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plac8l1Q08EJ0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plac8l1Q08EJ0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Plac8l1Q08EJ0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Plac8l1Q08EJ0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Plac8l1Q08EJ0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plac8l1Q08EJ0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plac8l1Q08EJ0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plac8l1Q08EJ0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plac8l1Q08EJ0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Plac8l1Q08EJ0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plac8l1Q08EJ0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plac8l1Q08EJ0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plac8l1Q08EJ0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Plac8l1Q08EJ0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Plac8l1Q08EJ0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Plac8l1Q08EJ0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Plac8l1Q08EJ0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Plac8l1Q08EJ0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plac8l1Q08EJ0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plac8l1Q08EJ0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Plac8l1Q08EJ0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Plac8l1Q08EJ0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Plac8l1Q08EJ0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Plac8l1Q08EJ0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Plac8l1Q08EJ0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plac8l1Q08EJ0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plac8l1Q08EJ0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plac8l1Q08EJ0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plac8l1Q08EJ0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plac8l1Q08EJ0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plac8l1Q08EJ0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plac8l1Q08EJ0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plac8l1Q08EJ0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plac8l1Q08EJ0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plac8l1Q08EJ0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plac8l1Q08EJ0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plac8l1Q08EJ0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plac8l1Q08EJ0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plac8l1Q08EJ0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plac8l1Q08EJ0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plac8l1Q08EJ0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plac8l1Q08EJ0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plac8l1Q08EJ0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plac8l1Q08EJ0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plac8l1Q08EJ0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plac8l1Q08EJ0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plac8l1Q08EJ0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plac8l1Q08EJ0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plac8l1Q08EJ0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plac8l1Q08EJ0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plac8l1Q08EJ0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plac8l1Q08EJ0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plac8l1Q08EJ0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plac8l1Q08EJ0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plac8l1Q08EJ0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plac8l1Q08EJ0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plac8l1Q08EJ0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plac8l1Q08EJ0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plac8l1Q08EJ0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plac8l1Q08EJ0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plac8l1Q08EJ0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plac8l1Q08EJ0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plac8l1Q08EJ0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plac8l1Q08EJ0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Plac8l1Q08EJ0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plac8l1Q08EJ0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plac8l1Q08EJ0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plac8l1Q08EJ0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plac8l1Q08EJ0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plac8l1Q08EJ0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plac8l1Q08EJ0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms