Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
F13bQ07968 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
F13bQ07968 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
F13bQ07968 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
F13bQ07968 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
F13bQ07968 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
F13bQ07968 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
F13bQ07968 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
F13bQ07968 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
F13bQ07968 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
F13bQ07968 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
F13bQ07968 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
F13bQ07968 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
F13bQ07968 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
F13bQ07968 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
F13bQ07968 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
F13bQ07968 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
F13bQ07968 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
F13bQ07968 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
F13bQ07968 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
F13bQ07968 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
F13bQ07968 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
F13bQ07968 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
F13bQ07968 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
F13bQ07968 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
F13bQ07968 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
F13bQ07968 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
F13bQ07968 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
F13bQ07968 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
F13bQ07968 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
F13bQ07968 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
F13bQ07968 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
F13bQ07968 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
F13bQ07968 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
F13bQ07968 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
F13bQ07968 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
F13bQ07968 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
F13bQ07968 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
F13bQ07968 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
F13bQ07968 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
F13bQ07968 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
F13bQ07968 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
F13bQ07968 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
F13bQ07968 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
F13bQ07968 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
F13bQ07968 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
F13bQ07968 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
F13bQ07968 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
F13bQ07968 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
F13bQ07968 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
F13bQ07968 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
F13bQ07968 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
F13bQ07968 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
F13bQ07968 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
F13bQ07968 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
F13bQ07968 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
F13bQ07968 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
F13bQ07968 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
F13bQ07968 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
F13bQ07968 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
F13bQ07968 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
F13bQ07968 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
F13bQ07968 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
F13bQ07968 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
F13bQ07968 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
F13bQ07968 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
F13bQ07968 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
F13bQ07968 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
F13bQ07968 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
F13bQ07968 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
F13bQ07968 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
F13bQ07968 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
F13bQ07968 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
F13bQ07968 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
F13bQ07968 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
F13bQ07968 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
F13bQ07968 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
F13bQ07968 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
F13bQ07968 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
F13bQ07968 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
F13bQ07968 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
F13bQ07968 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
F13bQ07968 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
F13bQ07968 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
F13bQ07968 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
F13bQ07968 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
F13bQ07968 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
F13bQ07968 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
F13bQ07968 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
F13bQ07968 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
F13bQ07968 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
F13bQ07968 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
F13bQ07968 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
F13bQ07968 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
F13bQ07968 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
F13bQ07968 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
F13bQ07968 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
F13bQ07968 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
F13bQ07968 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
F13bQ07968 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms