Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Atf4Q06507 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atf4Q06507 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atf4Q06507 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Atf4Q06507 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atf4Q06507 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atf4Q06507 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atf4Q06507 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atf4Q06507 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atf4Q06507 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atf4Q06507 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atf4Q06507 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atf4Q06507 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atf4Q06507 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atf4Q06507 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Atf4Q06507 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Atf4Q06507 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atf4Q06507 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atf4Q06507 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atf4Q06507 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atf4Q06507 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atf4Q06507 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Atf4Q06507 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atf4Q06507 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atf4Q06507 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atf4Q06507 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atf4Q06507 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atf4Q06507 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atf4Q06507 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atf4Q06507 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atf4Q06507 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atf4Q06507 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atf4Q06507 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atf4Q06507 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atf4Q06507 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atf4Q06507 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atf4Q06507 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atf4Q06507 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atf4Q06507 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atf4Q06507 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Atf4Q06507 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atf4Q06507 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atf4Q06507 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atf4Q06507 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Atf4Q06507 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atf4Q06507 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atf4Q06507 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atf4Q06507 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atf4Q06507 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atf4Q06507 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atf4Q06507 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atf4Q06507 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atf4Q06507 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Atf4Q06507 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atf4Q06507 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atf4Q06507 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atf4Q06507 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atf4Q06507 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atf4Q06507 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atf4Q06507 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atf4Q06507 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atf4Q06507 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atf4Q06507 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atf4Q06507 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atf4Q06507 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atf4Q06507 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atf4Q06507 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atf4Q06507 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atf4Q06507 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atf4Q06507 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atf4Q06507 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atf4Q06507 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atf4Q06507 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atf4Q06507 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atf4Q06507 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atf4Q06507 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atf4Q06507 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atf4Q06507 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atf4Q06507 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atf4Q06507 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atf4Q06507 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atf4Q06507 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atf4Q06507 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atf4Q06507 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atf4Q06507 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atf4Q06507 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atf4Q06507 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atf4Q06507 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atf4Q06507 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atf4Q06507 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atf4Q06507 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atf4Q06507 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atf4Q06507 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atf4Q06507 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Atf4Q06507 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atf4Q06507 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atf4Q06507 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Atf4Q06507 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atf4Q06507 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atf4Q06507 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms