Protein–RNA interactions for Protein: Q06180

Ptpn2, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 2, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn2Q06180 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptpn2Q06180 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptpn2Q06180 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptpn2Q06180 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptpn2Q06180 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptpn2Q06180 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptpn2Q06180 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptpn2Q06180 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptpn2Q06180 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptpn2Q06180 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptpn2Q06180 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptpn2Q06180 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptpn2Q06180 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptpn2Q06180 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptpn2Q06180 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptpn2Q06180 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptpn2Q06180 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptpn2Q06180 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptpn2Q06180 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptpn2Q06180 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ptpn2Q06180 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ptpn2Q06180 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptpn2Q06180 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptpn2Q06180 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptpn2Q06180 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptpn2Q06180 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptpn2Q06180 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptpn2Q06180 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptpn2Q06180 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptpn2Q06180 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptpn2Q06180 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptpn2Q06180 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptpn2Q06180 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptpn2Q06180 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptpn2Q06180 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptpn2Q06180 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptpn2Q06180 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptpn2Q06180 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptpn2Q06180 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptpn2Q06180 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptpn2Q06180 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptpn2Q06180 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptpn2Q06180 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptpn2Q06180 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptpn2Q06180 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptpn2Q06180 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptpn2Q06180 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptpn2Q06180 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptpn2Q06180 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptpn2Q06180 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptpn2Q06180 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptpn2Q06180 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptpn2Q06180 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptpn2Q06180 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ptpn2Q06180 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptpn2Q06180 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptpn2Q06180 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptpn2Q06180 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptpn2Q06180 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptpn2Q06180 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptpn2Q06180 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptpn2Q06180 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptpn2Q06180 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptpn2Q06180 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptpn2Q06180 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptpn2Q06180 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptpn2Q06180 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptpn2Q06180 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptpn2Q06180 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptpn2Q06180 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptpn2Q06180 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptpn2Q06180 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptpn2Q06180 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptpn2Q06180 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptpn2Q06180 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptpn2Q06180 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptpn2Q06180 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptpn2Q06180 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptpn2Q06180 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptpn2Q06180 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptpn2Q06180 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptpn2Q06180 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptpn2Q06180 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptpn2Q06180 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptpn2Q06180 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptpn2Q06180 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptpn2Q06180 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptpn2Q06180 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptpn2Q06180 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptpn2Q06180 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptpn2Q06180 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ptpn2Q06180 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptpn2Q06180 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptpn2Q06180 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptpn2Q06180 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptpn2Q06180 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptpn2Q06180 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptpn2Q06180 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptpn2Q06180 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptpn2Q06180 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms