Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sox9Q04887 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sox9Q04887 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sox9Q04887 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sox9Q04887 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sox9Q04887 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sox9Q04887 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sox9Q04887 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sox9Q04887 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sox9Q04887 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sox9Q04887 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sox9Q04887 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sox9Q04887 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sox9Q04887 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sox9Q04887 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sox9Q04887 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sox9Q04887 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sox9Q04887 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Sox9Q04887 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sox9Q04887 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sox9Q04887 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sox9Q04887 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Sox9Q04887 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sox9Q04887 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sox9Q04887 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Sox9Q04887 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sox9Q04887 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sox9Q04887 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sox9Q04887 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sox9Q04887 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sox9Q04887 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sox9Q04887 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sox9Q04887 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Sox9Q04887 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sox9Q04887 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sox9Q04887 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sox9Q04887 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sox9Q04887 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sox9Q04887 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sox9Q04887 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sox9Q04887 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sox9Q04887 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sox9Q04887 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sox9Q04887 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sox9Q04887 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sox9Q04887 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sox9Q04887 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sox9Q04887 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sox9Q04887 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sox9Q04887 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sox9Q04887 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sox9Q04887 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sox9Q04887 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sox9Q04887 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sox9Q04887 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sox9Q04887 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sox9Q04887 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sox9Q04887 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sox9Q04887 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sox9Q04887 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sox9Q04887 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sox9Q04887 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sox9Q04887 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sox9Q04887 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sox9Q04887 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sox9Q04887 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sox9Q04887 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sox9Q04887 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sox9Q04887 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sox9Q04887 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sox9Q04887 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sox9Q04887 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sox9Q04887 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sox9Q04887 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sox9Q04887 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Sox9Q04887 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sox9Q04887 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Sox9Q04887 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sox9Q04887 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Sox9Q04887 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sox9Q04887 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sox9Q04887 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sox9Q04887 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sox9Q04887 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sox9Q04887 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Sox9Q04887 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sox9Q04887 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sox9Q04887 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sox9Q04887 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sox9Q04887 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Sox9Q04887 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sox9Q04887 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sox9Q04887 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Sox9Q04887 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sox9Q04887 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sox9Q04887 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sox9Q04887 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sox9Q04887 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sox9Q04887 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sox9Q04887 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms