Protein–RNA interactions for Protein: Q04735

Cdk16, Cyclin-dependent kinase 16, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk16Q04735 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdk16Q04735 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdk16Q04735 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdk16Q04735 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdk16Q04735 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdk16Q04735 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdk16Q04735 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdk16Q04735 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdk16Q04735 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdk16Q04735 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdk16Q04735 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk16Q04735 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk16Q04735 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk16Q04735 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk16Q04735 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk16Q04735 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk16Q04735 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk16Q04735 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk16Q04735 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk16Q04735 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk16Q04735 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk16Q04735 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk16Q04735 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk16Q04735 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk16Q04735 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk16Q04735 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk16Q04735 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk16Q04735 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk16Q04735 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk16Q04735 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk16Q04735 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk16Q04735 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk16Q04735 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk16Q04735 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk16Q04735 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk16Q04735 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdk16Q04735 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk16Q04735 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk16Q04735 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk16Q04735 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk16Q04735 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk16Q04735 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk16Q04735 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk16Q04735 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk16Q04735 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk16Q04735 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk16Q04735 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk16Q04735 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk16Q04735 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk16Q04735 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk16Q04735 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk16Q04735 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk16Q04735 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk16Q04735 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk16Q04735 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk16Q04735 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk16Q04735 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk16Q04735 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk16Q04735 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk16Q04735 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk16Q04735 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk16Q04735 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk16Q04735 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk16Q04735 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk16Q04735 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk16Q04735 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk16Q04735 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk16Q04735 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdk16Q04735 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdk16Q04735 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdk16Q04735 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdk16Q04735 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdk16Q04735 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
Cdk16Q04735 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cdk16Q04735 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdk16Q04735 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdk16Q04735 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdk16Q04735 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdk16Q04735 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdk16Q04735 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdk16Q04735 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdk16Q04735 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdk16Q04735 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdk16Q04735 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdk16Q04735 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk16Q04735 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk16Q04735 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk16Q04735 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk16Q04735 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk16Q04735 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk16Q04735 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk16Q04735 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk16Q04735 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk16Q04735 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk16Q04735 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk16Q04735 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk16Q04735 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk16Q04735 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk16Q04735 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk16Q04735 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms