Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NfiaQ02780 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NfiaQ02780 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NfiaQ02780 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NfiaQ02780 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NfiaQ02780 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NfiaQ02780 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NfiaQ02780 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NfiaQ02780 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NfiaQ02780 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NfiaQ02780 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NfiaQ02780 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NfiaQ02780 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NfiaQ02780 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NfiaQ02780 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NfiaQ02780 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NfiaQ02780 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NfiaQ02780 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NfiaQ02780 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NfiaQ02780 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NfiaQ02780 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NfiaQ02780 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NfiaQ02780 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NfiaQ02780 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NfiaQ02780 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NfiaQ02780 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NfiaQ02780 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NfiaQ02780 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NfiaQ02780 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NfiaQ02780 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NfiaQ02780 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NfiaQ02780 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NfiaQ02780 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NfiaQ02780 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NfiaQ02780 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NfiaQ02780 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NfiaQ02780 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NfiaQ02780 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NfiaQ02780 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NfiaQ02780 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NfiaQ02780 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NfiaQ02780 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NfiaQ02780 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NfiaQ02780 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NfiaQ02780 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NfiaQ02780 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NfiaQ02780 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NfiaQ02780 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NfiaQ02780 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NfiaQ02780 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NfiaQ02780 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NfiaQ02780 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NfiaQ02780 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NfiaQ02780 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NfiaQ02780 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NfiaQ02780 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NfiaQ02780 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NfiaQ02780 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NfiaQ02780 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NfiaQ02780 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NfiaQ02780 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NfiaQ02780 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NfiaQ02780 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NfiaQ02780 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NfiaQ02780 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NfiaQ02780 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NfiaQ02780 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NfiaQ02780 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NfiaQ02780 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NfiaQ02780 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NfiaQ02780 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NfiaQ02780 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NfiaQ02780 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NfiaQ02780 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
NfiaQ02780 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NfiaQ02780 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NfiaQ02780 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NfiaQ02780 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NfiaQ02780 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NfiaQ02780 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NfiaQ02780 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NfiaQ02780 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NfiaQ02780 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NfiaQ02780 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NfiaQ02780 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NfiaQ02780 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NfiaQ02780 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NfiaQ02780 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NfiaQ02780 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NfiaQ02780 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NfiaQ02780 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NfiaQ02780 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NfiaQ02780 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NfiaQ02780 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NfiaQ02780 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NfiaQ02780 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NfiaQ02780 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NfiaQ02780 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NfiaQ02780 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NfiaQ02780 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms