Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gjb5Q02739 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gjb5Q02739 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gjb5Q02739 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gjb5Q02739 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gjb5Q02739 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gjb5Q02739 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gjb5Q02739 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gjb5Q02739 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gjb5Q02739 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gjb5Q02739 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gjb5Q02739 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gjb5Q02739 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gjb5Q02739 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gjb5Q02739 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gjb5Q02739 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gjb5Q02739 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gjb5Q02739 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gjb5Q02739 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gjb5Q02739 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gjb5Q02739 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gjb5Q02739 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gjb5Q02739 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gjb5Q02739 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gjb5Q02739 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gjb5Q02739 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gjb5Q02739 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gjb5Q02739 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gjb5Q02739 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gjb5Q02739 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gjb5Q02739 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gjb5Q02739 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gjb5Q02739 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gjb5Q02739 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gjb5Q02739 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gjb5Q02739 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gjb5Q02739 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gjb5Q02739 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gjb5Q02739 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gjb5Q02739 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gjb5Q02739 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gjb5Q02739 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gjb5Q02739 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gjb5Q02739 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gjb5Q02739 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gjb5Q02739 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gjb5Q02739 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gjb5Q02739 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gjb5Q02739 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gjb5Q02739 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gjb5Q02739 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gjb5Q02739 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gjb5Q02739 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gjb5Q02739 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gjb5Q02739 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gjb5Q02739 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjb5Q02739 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjb5Q02739 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjb5Q02739 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjb5Q02739 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjb5Q02739 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjb5Q02739 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjb5Q02739 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjb5Q02739 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjb5Q02739 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjb5Q02739 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gjb5Q02739 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gjb5Q02739 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjb5Q02739 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjb5Q02739 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjb5Q02739 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gjb5Q02739 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjb5Q02739 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjb5Q02739 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjb5Q02739 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjb5Q02739 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjb5Q02739 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjb5Q02739 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjb5Q02739 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjb5Q02739 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjb5Q02739 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjb5Q02739 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjb5Q02739 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gjb5Q02739 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gjb5Q02739 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gjb5Q02739 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gjb5Q02739 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gjb5Q02739 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gjb5Q02739 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gjb5Q02739 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gjb5Q02739 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gjb5Q02739 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gjb5Q02739 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gjb5Q02739 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gjb5Q02739 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Gjb5Q02739 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gjb5Q02739 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gjb5Q02739 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gjb5Q02739 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gjb5Q02739 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.6 ms