Protein–RNA interactions for Protein: Q01965

Ly9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly9Q01965 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ly9Q01965 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ly9Q01965 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ly9Q01965 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ly9Q01965 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ly9Q01965 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ly9Q01965 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ly9Q01965 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ly9Q01965 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ly9Q01965 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ly9Q01965 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ly9Q01965 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ly9Q01965 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ly9Q01965 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ly9Q01965 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ly9Q01965 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ly9Q01965 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ly9Q01965 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ly9Q01965 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ly9Q01965 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ly9Q01965 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ly9Q01965 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ly9Q01965 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ly9Q01965 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ly9Q01965 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ly9Q01965 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ly9Q01965 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ly9Q01965 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ly9Q01965 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ly9Q01965 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ly9Q01965 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ly9Q01965 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ly9Q01965 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ly9Q01965 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ly9Q01965 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ly9Q01965 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ly9Q01965 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ly9Q01965 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ly9Q01965 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ly9Q01965 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ly9Q01965 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ly9Q01965 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ly9Q01965 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ly9Q01965 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ly9Q01965 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ly9Q01965 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ly9Q01965 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ly9Q01965 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ly9Q01965 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ly9Q01965 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ly9Q01965 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ly9Q01965 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ly9Q01965 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ly9Q01965 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ly9Q01965 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ly9Q01965 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ly9Q01965 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ly9Q01965 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ly9Q01965 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ly9Q01965 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ly9Q01965 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ly9Q01965 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ly9Q01965 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ly9Q01965 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ly9Q01965 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ly9Q01965 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ly9Q01965 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ly9Q01965 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ly9Q01965 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ly9Q01965 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ly9Q01965 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ly9Q01965 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ly9Q01965 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ly9Q01965 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ly9Q01965 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ly9Q01965 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ly9Q01965 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ly9Q01965 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ly9Q01965 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ly9Q01965 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ly9Q01965 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ly9Q01965 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ly9Q01965 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ly9Q01965 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ly9Q01965 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ly9Q01965 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ly9Q01965 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ly9Q01965 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ly9Q01965 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ly9Q01965 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ly9Q01965 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ly9Q01965 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ly9Q01965 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ly9Q01965 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ly9Q01965 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ly9Q01965 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ly9Q01965 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ly9Q01965 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ly9Q01965 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ly9Q01965 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms