Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lama4P97927 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Lama4P97927 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Lama4P97927 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Lama4P97927 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lama4P97927 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lama4P97927 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lama4P97927 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lama4P97927 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lama4P97927 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lama4P97927 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lama4P97927 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lama4P97927 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lama4P97927 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lama4P97927 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lama4P97927 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Lama4P97927 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lama4P97927 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lama4P97927 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lama4P97927 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lama4P97927 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lama4P97927 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lama4P97927 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lama4P97927 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lama4P97927 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lama4P97927 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lama4P97927 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lama4P97927 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Lama4P97927 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lama4P97927 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lama4P97927 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lama4P97927 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lama4P97927 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lama4P97927 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lama4P97927 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lama4P97927 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lama4P97927 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lama4P97927 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lama4P97927 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lama4P97927 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lama4P97927 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lama4P97927 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lama4P97927 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lama4P97927 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Lama4P97927 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lama4P97927 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lama4P97927 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lama4P97927 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lama4P97927 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lama4P97927 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lama4P97927 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lama4P97927 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lama4P97927 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lama4P97927 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lama4P97927 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lama4P97927 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lama4P97927 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lama4P97927 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Lama4P97927 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lama4P97927 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lama4P97927 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Lama4P97927 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lama4P97927 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Lama4P97927 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lama4P97927 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lama4P97927 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Lama4P97927 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lama4P97927 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lama4P97927 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lama4P97927 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lama4P97927 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lama4P97927 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lama4P97927 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lama4P97927 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lama4P97927 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Lama4P97927 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lama4P97927 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lama4P97927 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Lama4P97927 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Lama4P97927 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Lama4P97927 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lama4P97927 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lama4P97927 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lama4P97927 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lama4P97927 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lama4P97927 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lama4P97927 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lama4P97927 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lama4P97927 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lama4P97927 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lama4P97927 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lama4P97927 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lama4P97927 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lama4P97927 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Lama4P97927 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lama4P97927 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lama4P97927 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lama4P97927 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lama4P97927 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lama4P97927 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms