Protein–RNA interactions for Protein: P97858

Slc35b1, Solute carrier family 35 member B1, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc35b1P97858 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc35b1P97858 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc35b1P97858 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc35b1P97858 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc35b1P97858 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc35b1P97858 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc35b1P97858 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc35b1P97858 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc35b1P97858 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc35b1P97858 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc35b1P97858 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc35b1P97858 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc35b1P97858 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc35b1P97858 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc35b1P97858 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc35b1P97858 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc35b1P97858 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc35b1P97858 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc35b1P97858 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc35b1P97858 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc35b1P97858 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc35b1P97858 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc35b1P97858 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc35b1P97858 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc35b1P97858 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc35b1P97858 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc35b1P97858 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc35b1P97858 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc35b1P97858 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc35b1P97858 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc35b1P97858 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc35b1P97858 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc35b1P97858 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc35b1P97858 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc35b1P97858 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc35b1P97858 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc35b1P97858 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc35b1P97858 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc35b1P97858 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc35b1P97858 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc35b1P97858 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc35b1P97858 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc35b1P97858 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc35b1P97858 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc35b1P97858 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc35b1P97858 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc35b1P97858 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc35b1P97858 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc35b1P97858 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc35b1P97858 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc35b1P97858 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc35b1P97858 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc35b1P97858 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc35b1P97858 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc35b1P97858 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc35b1P97858 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc35b1P97858 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc35b1P97858 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc35b1P97858 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc35b1P97858 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc35b1P97858 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc35b1P97858 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc35b1P97858 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc35b1P97858 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc35b1P97858 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc35b1P97858 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc35b1P97858 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc35b1P97858 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc35b1P97858 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc35b1P97858 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc35b1P97858 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc35b1P97858 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc35b1P97858 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc35b1P97858 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc35b1P97858 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc35b1P97858 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Slc35b1P97858 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc35b1P97858 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc35b1P97858 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc35b1P97858 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc35b1P97858 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc35b1P97858 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc35b1P97858 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc35b1P97858 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc35b1P97858 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc35b1P97858 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc35b1P97858 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc35b1P97858 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc35b1P97858 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc35b1P97858 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc35b1P97858 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc35b1P97858 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc35b1P97858 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc35b1P97858 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc35b1P97858 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc35b1P97858 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc35b1P97858 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc35b1P97858 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc35b1P97858 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc35b1P97858 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms