Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Npas2P97460 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Npas2P97460 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Npas2P97460 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Npas2P97460 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Npas2P97460 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Npas2P97460 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Npas2P97460 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Npas2P97460 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Npas2P97460 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Npas2P97460 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Npas2P97460 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Npas2P97460 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Npas2P97460 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Npas2P97460 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Npas2P97460 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Npas2P97460 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Npas2P97460 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Npas2P97460 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Npas2P97460 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Npas2P97460 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Npas2P97460 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Npas2P97460 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Npas2P97460 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Npas2P97460 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Npas2P97460 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Npas2P97460 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Npas2P97460 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Npas2P97460 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Npas2P97460 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Npas2P97460 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Npas2P97460 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Npas2P97460 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Npas2P97460 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Npas2P97460 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Npas2P97460 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Npas2P97460 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Npas2P97460 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Npas2P97460 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Npas2P97460 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Npas2P97460 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Npas2P97460 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Npas2P97460 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Npas2P97460 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Npas2P97460 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Npas2P97460 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Npas2P97460 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Npas2P97460 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Npas2P97460 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Npas2P97460 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Npas2P97460 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Npas2P97460 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Npas2P97460 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Npas2P97460 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Npas2P97460 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Npas2P97460 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Npas2P97460 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Npas2P97460 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Npas2P97460 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Npas2P97460 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Npas2P97460 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Npas2P97460 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Npas2P97460 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Npas2P97460 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Npas2P97460 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Npas2P97460 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Npas2P97460 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Npas2P97460 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Npas2P97460 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Npas2P97460 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Npas2P97460 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Npas2P97460 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Npas2P97460 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Npas2P97460 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Npas2P97460 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Npas2P97460 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Npas2P97460 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Npas2P97460 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Npas2P97460 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Npas2P97460 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Npas2P97460 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Npas2P97460 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Npas2P97460 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Npas2P97460 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Npas2P97460 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Npas2P97460 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Npas2P97460 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Npas2P97460 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Npas2P97460 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Npas2P97460 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Npas2P97460 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Npas2P97460 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Npas2P97460 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Npas2P97460 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Npas2P97460 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Npas2P97460 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Npas2P97460 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Npas2P97460 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Npas2P97460 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Npas2P97460 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms