Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gbx1P82976 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gbx1P82976 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gbx1P82976 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gbx1P82976 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gbx1P82976 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gbx1P82976 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gbx1P82976 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gbx1P82976 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gbx1P82976 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbx1P82976 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gbx1P82976 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbx1P82976 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbx1P82976 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbx1P82976 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbx1P82976 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbx1P82976 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbx1P82976 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbx1P82976 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbx1P82976 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbx1P82976 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbx1P82976 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbx1P82976 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gbx1P82976 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gbx1P82976 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gbx1P82976 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gbx1P82976 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gbx1P82976 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gbx1P82976 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gbx1P82976 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gbx1P82976 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gbx1P82976 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbx1P82976 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbx1P82976 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbx1P82976 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbx1P82976 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbx1P82976 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbx1P82976 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbx1P82976 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbx1P82976 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbx1P82976 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbx1P82976 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbx1P82976 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbx1P82976 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbx1P82976 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbx1P82976 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbx1P82976 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbx1P82976 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gbx1P82976 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gbx1P82976 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gbx1P82976 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gbx1P82976 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gbx1P82976 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gbx1P82976 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gbx1P82976 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gbx1P82976 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gbx1P82976 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gbx1P82976 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Gbx1P82976 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gbx1P82976 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gbx1P82976 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gbx1P82976 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gbx1P82976 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gbx1P82976 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gbx1P82976 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gbx1P82976 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gbx1P82976 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gbx1P82976 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gbx1P82976 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gbx1P82976 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gbx1P82976 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gbx1P82976 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gbx1P82976 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gbx1P82976 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gbx1P82976 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gbx1P82976 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gbx1P82976 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gbx1P82976 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gbx1P82976 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gbx1P82976 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gbx1P82976 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gbx1P82976 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gbx1P82976 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gbx1P82976 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gbx1P82976 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gbx1P82976 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gbx1P82976 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gbx1P82976 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gbx1P82976 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gbx1P82976 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gbx1P82976 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gbx1P82976 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gbx1P82976 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gbx1P82976 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gbx1P82976 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gbx1P82976 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gbx1P82976 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gbx1P82976 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gbx1P82976 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gbx1P82976 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms