Protein–RNA interactions for Protein: P70339

Frat1, Proto-oncogene FRAT1, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frat1P70339 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Frat1P70339 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Frat1P70339 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Frat1P70339 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Frat1P70339 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Frat1P70339 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Frat1P70339 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Frat1P70339 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Frat1P70339 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Frat1P70339 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Frat1P70339 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Frat1P70339 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Frat1P70339 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Frat1P70339 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Frat1P70339 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Frat1P70339 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Frat1P70339 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Frat1P70339 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Frat1P70339 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Frat1P70339 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Frat1P70339 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Frat1P70339 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Frat1P70339 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Frat1P70339 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Frat1P70339 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Frat1P70339 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Frat1P70339 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Frat1P70339 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Frat1P70339 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Frat1P70339 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Frat1P70339 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Frat1P70339 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Frat1P70339 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Frat1P70339 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Frat1P70339 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Frat1P70339 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Frat1P70339 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Frat1P70339 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Frat1P70339 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Frat1P70339 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Frat1P70339 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Frat1P70339 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Frat1P70339 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Frat1P70339 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Frat1P70339 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Frat1P70339 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Frat1P70339 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Frat1P70339 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Frat1P70339 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Frat1P70339 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Frat1P70339 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Frat1P70339 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Frat1P70339 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Frat1P70339 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Frat1P70339 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Frat1P70339 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Frat1P70339 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Frat1P70339 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Frat1P70339 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Frat1P70339 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Frat1P70339 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Frat1P70339 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Frat1P70339 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Frat1P70339 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Frat1P70339 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Frat1P70339 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Frat1P70339 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Frat1P70339 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Frat1P70339 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Frat1P70339 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Frat1P70339 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Frat1P70339 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Frat1P70339 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Frat1P70339 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Frat1P70339 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Frat1P70339 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Frat1P70339 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Frat1P70339 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Frat1P70339 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Frat1P70339 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Frat1P70339 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Frat1P70339 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Frat1P70339 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Frat1P70339 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Frat1P70339 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Frat1P70339 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Frat1P70339 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Frat1P70339 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Frat1P70339 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Frat1P70339 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Frat1P70339 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Frat1P70339 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Frat1P70339 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Frat1P70339 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Frat1P70339 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Frat1P70339 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Frat1P70339 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Frat1P70339 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Frat1P70339 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Frat1P70339 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms