Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pkn1P70268 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pkn1P70268 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Pkn1P70268 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Pkn1P70268 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pkn1P70268 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pkn1P70268 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pkn1P70268 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Pkn1P70268 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Pkn1P70268 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pkn1P70268 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pkn1P70268 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pkn1P70268 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pkn1P70268 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pkn1P70268 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pkn1P70268 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pkn1P70268 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pkn1P70268 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pkn1P70268 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pkn1P70268 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pkn1P70268 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pkn1P70268 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pkn1P70268 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pkn1P70268 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pkn1P70268 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pkn1P70268 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pkn1P70268 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pkn1P70268 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pkn1P70268 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pkn1P70268 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pkn1P70268 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pkn1P70268 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pkn1P70268 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pkn1P70268 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pkn1P70268 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pkn1P70268 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pkn1P70268 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pkn1P70268 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pkn1P70268 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pkn1P70268 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pkn1P70268 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pkn1P70268 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pkn1P70268 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pkn1P70268 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pkn1P70268 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pkn1P70268 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pkn1P70268 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pkn1P70268 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pkn1P70268 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pkn1P70268 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Pkn1P70268 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pkn1P70268 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pkn1P70268 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pkn1P70268 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pkn1P70268 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pkn1P70268 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pkn1P70268 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pkn1P70268 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pkn1P70268 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pkn1P70268 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pkn1P70268 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pkn1P70268 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pkn1P70268 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pkn1P70268 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pkn1P70268 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pkn1P70268 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pkn1P70268 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pkn1P70268 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pkn1P70268 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pkn1P70268 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pkn1P70268 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pkn1P70268 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pkn1P70268 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pkn1P70268 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pkn1P70268 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Pkn1P70268 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pkn1P70268 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Pkn1P70268 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pkn1P70268 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pkn1P70268 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pkn1P70268 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pkn1P70268 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pkn1P70268 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pkn1P70268 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pkn1P70268 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pkn1P70268 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pkn1P70268 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pkn1P70268 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Pkn1P70268 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pkn1P70268 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pkn1P70268 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pkn1P70268 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pkn1P70268 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pkn1P70268 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pkn1P70268 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pkn1P70268 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pkn1P70268 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pkn1P70268 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pkn1P70268 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pkn1P70268 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms