Protein–RNA interactions for Protein: P63254

Crip1, Cysteine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crip1P63254 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Crip1P63254 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Crip1P63254 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Crip1P63254 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Crip1P63254 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Crip1P63254 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Crip1P63254 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Crip1P63254 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Crip1P63254 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Crip1P63254 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Crip1P63254 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Crip1P63254 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Crip1P63254 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Crip1P63254 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Crip1P63254 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Crip1P63254 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Crip1P63254 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Crip1P63254 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Crip1P63254 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Crip1P63254 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Crip1P63254 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Crip1P63254 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Crip1P63254 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Crip1P63254 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Crip1P63254 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Crip1P63254 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Crip1P63254 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Crip1P63254 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Crip1P63254 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Crip1P63254 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Crip1P63254 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Crip1P63254 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Crip1P63254 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Crip1P63254 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Crip1P63254 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Crip1P63254 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Crip1P63254 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Crip1P63254 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Crip1P63254 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Crip1P63254 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Crip1P63254 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Crip1P63254 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Crip1P63254 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Crip1P63254 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Crip1P63254 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Crip1P63254 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Crip1P63254 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Crip1P63254 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Crip1P63254 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Crip1P63254 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Crip1P63254 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Crip1P63254 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Crip1P63254 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Crip1P63254 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Crip1P63254 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Crip1P63254 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Crip1P63254 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Crip1P63254 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Crip1P63254 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Crip1P63254 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Crip1P63254 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Crip1P63254 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Crip1P63254 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Crip1P63254 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Crip1P63254 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Crip1P63254 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Crip1P63254 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Crip1P63254 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Crip1P63254 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Crip1P63254 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Crip1P63254 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Crip1P63254 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Crip1P63254 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Crip1P63254 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Crip1P63254 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Crip1P63254 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Crip1P63254 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Crip1P63254 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Crip1P63254 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Crip1P63254 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Crip1P63254 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Crip1P63254 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Crip1P63254 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Crip1P63254 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Crip1P63254 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Crip1P63254 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Crip1P63254 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Crip1P63254 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Crip1P63254 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Crip1P63254 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Crip1P63254 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Crip1P63254 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Crip1P63254 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Crip1P63254 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Crip1P63254 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Crip1P63254 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Crip1P63254 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Crip1P63254 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Crip1P63254 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Crip1P63254 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms