Protein–RNA interactions for Protein: P62918

Rpl8, 60S ribosomal protein L8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl8P62918 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpl8P62918 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl8P62918 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl8P62918 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl8P62918 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl8P62918 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl8P62918 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl8P62918 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl8P62918 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl8P62918 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl8P62918 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl8P62918 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl8P62918 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl8P62918 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl8P62918 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl8P62918 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl8P62918 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl8P62918 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl8P62918 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl8P62918 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl8P62918 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl8P62918 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl8P62918 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl8P62918 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl8P62918 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl8P62918 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl8P62918 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl8P62918 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl8P62918 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl8P62918 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl8P62918 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl8P62918 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl8P62918 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl8P62918 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl8P62918 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl8P62918 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl8P62918 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl8P62918 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl8P62918 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl8P62918 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl8P62918 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl8P62918 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl8P62918 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl8P62918 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl8P62918 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl8P62918 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl8P62918 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl8P62918 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl8P62918 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl8P62918 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl8P62918 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl8P62918 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl8P62918 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl8P62918 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl8P62918 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl8P62918 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl8P62918 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl8P62918 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl8P62918 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl8P62918 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl8P62918 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl8P62918 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl8P62918 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl8P62918 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl8P62918 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rpl8P62918 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl8P62918 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl8P62918 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl8P62918 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl8P62918 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl8P62918 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl8P62918 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl8P62918 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl8P62918 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl8P62918 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl8P62918 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl8P62918 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl8P62918 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl8P62918 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl8P62918 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl8P62918 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl8P62918 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl8P62918 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl8P62918 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl8P62918 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl8P62918 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl8P62918 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl8P62918 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl8P62918 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl8P62918 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl8P62918 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl8P62918 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl8P62918 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl8P62918 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl8P62918 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl8P62918 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl8P62918 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl8P62918 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl8P62918 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl8P62918 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms