Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,74□□□□□ -0,21
Rps28P62858 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13,74□□□□□ -0,21
Rps28P62858 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13,74□□□□□ -0,21
Rps28P62858 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13,74□□□□□ -0,21
Rps28P62858 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,74□□□□□ -0,21
Rps28P62858 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC13,74□□□□□ -0,21
Rps28P62858 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,74□□□□□ -0,21
Rps28P62858 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC13,73□□□□□ -0,21
Rps28P62858 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC13,73□□□□□ -0,21
Rps28P62858 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC13,72□□□□□ -0,21
Rps28P62858 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,72□□□□□ -0,21
Rps28P62858 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,72□□□□□ -0,21
Rps28P62858 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,72□□□□□ -0,21
Rps28P62858 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,71□□□□□ -0,21
Rps28P62858 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,71□□□□□ -0,21
Rps28P62858 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13,71□□□□□ -0,21
Rps28P62858 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,71□□□□□ -0,21
Rps28P62858 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC13,71□□□□□ -0,21
Rps28P62858 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC13,71□□□□□ -0,22
Rps28P62858 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13,71□□□□□ -0,22
Rps28P62858 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13,7□□□□□ -0,22
Rps28P62858 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13,7□□□□□ -0,22
Rps28P62858 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,7□□□□□ -0,22
Rps28P62858 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC13,7□□□□□ -0,22
Rps28P62858 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13,7□□□□□ -0,22
Rps28P62858 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13,7□□□□□ -0,22
Rps28P62858 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,69□□□□□ -0,22
Rps28P62858 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,69□□□□□ -0,22
Rps28P62858 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,69□□□□□ -0,22
Rps28P62858 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC13,69□□□□□ -0,22
Rps28P62858 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13,69□□□□□ -0,22
Rps28P62858 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13,69□□□□□ -0,22
Rps28P62858 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC13,69□□□□□ -0,22
Rps28P62858 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,69□□□□□ -0,22
Rps28P62858 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,68□□□□□ -0,22
Rps28P62858 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13,68□□□□□ -0,22
Rps28P62858 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13,68□□□□□ -0,22
Rps28P62858 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC13,68□□□□□ -0,22
Rps28P62858 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13,68□□□□□ -0,22
Rps28P62858 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,68□□□□□ -0,22
Rps28P62858 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,68□□□□□ -0,22
Rps28P62858 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13,68□□□□□ -0,22
Rps28P62858 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13,68□□□□□ -0,22
Rps28P62858 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,68□□□□□ -0,22
Rps28P62858 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,68□□□□□ -0,22
Rps28P62858 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,67□□□□□ -0,22
Rps28P62858 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,67□□□□□ -0,22
Rps28P62858 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13,67□□□□□ -0,22
Rps28P62858 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13,67□□□□□ -0,22
Rps28P62858 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC13,67□□□□□ -0,22
Rps28P62858 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,67□□□□□ -0,22
Rps28P62858 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,67□□□□□ -0,22
Rps28P62858 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,66□□□□□ -0,22
Rps28P62858 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC13,66□□□□□ -0,22
Rps28P62858 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13,66□□□□□ -0,22
Rps28P62858 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,66□□□□□ -0,22
Rps28P62858 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,66□□□□□ -0,22
Rps28P62858 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13,66□□□□□ -0,22
Rps28P62858 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13,66□□□□□ -0,22
Rps28P62858 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,65□□□□□ -0,22
Rps28P62858 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,65□□□□□ -0,22
Rps28P62858 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13,65□□□□□ -0,22
Rps28P62858 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,65□□□□□ -0,22
Rps28P62858 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,65□□□□□ -0,22
Rps28P62858 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC13,65□□□□□ -0,22
Rps28P62858 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,64□□□□□ -0,23
Rps28P62858 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13,64□□□□□ -0,23
Rps28P62858 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC13,64□□□□□ -0,23
Rps28P62858 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13,64□□□□□ -0,23
Rps28P62858 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13,64□□□□□ -0,23
Rps28P62858 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,64□□□□□ -0,23
Rps28P62858 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13,64□□□□□ -0,23
Rps28P62858 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC13,64□□□□□ -0,23
Rps28P62858 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC13,63□□□□□ -0,23
Rps28P62858 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC13,63□□□□□ -0,23
Rps28P62858 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC13,63□□□□□ -0,23
Rps28P62858 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,63□□□□□ -0,23
Rps28P62858 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,63□□□□□ -0,23
Rps28P62858 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,62□□□□□ -0,23
Rps28P62858 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13,62□□□□□ -0,23
Rps28P62858 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,62□□□□□ -0,23
Rps28P62858 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13,62□□□□□ -0,23
Rps28P62858 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,62□□□□□ -0,23
Rps28P62858 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,62□□□□□ -0,23
Rps28P62858 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,62□□□□□ -0,23
Rps28P62858 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13,61□□□□□ -0,23
Rps28P62858 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13,61□□□□□ -0,23
Rps28P62858 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13,61□□□□□ -0,23
Rps28P62858 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,61□□□□□ -0,23
Rps28P62858 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC13,6□□□□□ -0,23
Rps28P62858 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC13,6□□□□□ -0,23
Rps28P62858 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13,6□□□□□ -0,23
Rps28P62858 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC13,6□□□□□ -0,23
Rps28P62858 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,6□□□□□ -0,23
Rps28P62858 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,6□□□□□ -0,23
Rps28P62858 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,6□□□□□ -0,23
Rps28P62858 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,6□□□□□ -0,23
Rps28P62858 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,6□□□□□ -0,23
Rps28P62858 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13,6□□□□□ -0,23
Rps28P62858 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13,6□□□□□ -0,23
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