Protein–RNA interactions for Protein: P62046

Lrch1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch1P62046 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Lrch1P62046 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Lrch1P62046 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Lrch1P62046 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lrch1P62046 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lrch1P62046 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Lrch1P62046 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lrch1P62046 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Lrch1P62046 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lrch1P62046 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Lrch1P62046 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Lrch1P62046 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lrch1P62046 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Lrch1P62046 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lrch1P62046 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Lrch1P62046 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Lrch1P62046 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lrch1P62046 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Lrch1P62046 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Lrch1P62046 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lrch1P62046 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Lrch1P62046 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Lrch1P62046 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lrch1P62046 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lrch1P62046 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lrch1P62046 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lrch1P62046 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrch1P62046 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrch1P62046 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrch1P62046 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrch1P62046 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrch1P62046 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrch1P62046 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrch1P62046 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lrch1P62046 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lrch1P62046 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lrch1P62046 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Lrch1P62046 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lrch1P62046 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lrch1P62046 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Lrch1P62046 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lrch1P62046 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lrch1P62046 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lrch1P62046 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lrch1P62046 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lrch1P62046 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lrch1P62046 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lrch1P62046 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lrch1P62046 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lrch1P62046 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Lrch1P62046 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lrch1P62046 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lrch1P62046 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lrch1P62046 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lrch1P62046 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lrch1P62046 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lrch1P62046 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lrch1P62046 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lrch1P62046 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lrch1P62046 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lrch1P62046 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lrch1P62046 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lrch1P62046 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lrch1P62046 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lrch1P62046 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lrch1P62046 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lrch1P62046 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lrch1P62046 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lrch1P62046 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lrch1P62046 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Lrch1P62046 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lrch1P62046 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lrch1P62046 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lrch1P62046 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lrch1P62046 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lrch1P62046 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lrch1P62046 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lrch1P62046 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lrch1P62046 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lrch1P62046 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lrch1P62046 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lrch1P62046 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lrch1P62046 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lrch1P62046 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lrch1P62046 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lrch1P62046 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lrch1P62046 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Lrch1P62046 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Lrch1P62046 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lrch1P62046 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lrch1P62046 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lrch1P62046 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lrch1P62046 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lrch1P62046 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lrch1P62046 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lrch1P62046 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lrch1P62046 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lrch1P62046 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lrch1P62046 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lrch1P62046 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms