Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ube2kP61087 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ube2kP61087 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ube2kP61087 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ube2kP61087 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ube2kP61087 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ube2kP61087 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ube2kP61087 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ube2kP61087 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ube2kP61087 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ube2kP61087 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ube2kP61087 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ube2kP61087 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ube2kP61087 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ube2kP61087 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ube2kP61087 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ube2kP61087 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ube2kP61087 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ube2kP61087 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ube2kP61087 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ube2kP61087 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ube2kP61087 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ube2kP61087 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ube2kP61087 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ube2kP61087 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ube2kP61087 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ube2kP61087 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ube2kP61087 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ube2kP61087 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ube2kP61087 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ube2kP61087 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ube2kP61087 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ube2kP61087 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ube2kP61087 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ube2kP61087 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ube2kP61087 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ube2kP61087 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ube2kP61087 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ube2kP61087 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ube2kP61087 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ube2kP61087 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ube2kP61087 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ube2kP61087 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ube2kP61087 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ube2kP61087 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ube2kP61087 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ube2kP61087 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ube2kP61087 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ube2kP61087 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ube2kP61087 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ube2kP61087 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ube2kP61087 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ube2kP61087 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ube2kP61087 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ube2kP61087 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ube2kP61087 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ube2kP61087 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Ube2kP61087 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Ube2kP61087 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ube2kP61087 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ube2kP61087 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ube2kP61087 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ube2kP61087 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ube2kP61087 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ube2kP61087 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ube2kP61087 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ube2kP61087 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ube2kP61087 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ube2kP61087 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ube2kP61087 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ube2kP61087 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2kP61087 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2kP61087 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2kP61087 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2kP61087 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2kP61087 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2kP61087 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2kP61087 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ube2kP61087 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ube2kP61087 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ube2kP61087 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ube2kP61087 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ube2kP61087 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ube2kP61087 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ube2kP61087 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ube2kP61087 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ube2kP61087 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ube2kP61087 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ube2kP61087 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ube2kP61087 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ube2kP61087 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ube2kP61087 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ube2kP61087 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ube2kP61087 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2kP61087 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2kP61087 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2kP61087 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2kP61087 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2kP61087 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2kP61087 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms