Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcbp1P60335 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcbp1P60335 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcbp1P60335 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcbp1P60335 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcbp1P60335 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcbp1P60335 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcbp1P60335 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcbp1P60335 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcbp1P60335 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcbp1P60335 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcbp1P60335 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcbp1P60335 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcbp1P60335 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcbp1P60335 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcbp1P60335 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcbp1P60335 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcbp1P60335 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcbp1P60335 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pcbp1P60335 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Pcbp1P60335 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcbp1P60335 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcbp1P60335 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcbp1P60335 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcbp1P60335 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcbp1P60335 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcbp1P60335 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcbp1P60335 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcbp1P60335 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcbp1P60335 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcbp1P60335 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcbp1P60335 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcbp1P60335 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcbp1P60335 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcbp1P60335 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcbp1P60335 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcbp1P60335 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcbp1P60335 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcbp1P60335 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcbp1P60335 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcbp1P60335 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcbp1P60335 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcbp1P60335 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcbp1P60335 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcbp1P60335 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcbp1P60335 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcbp1P60335 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcbp1P60335 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcbp1P60335 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcbp1P60335 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcbp1P60335 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcbp1P60335 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcbp1P60335 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcbp1P60335 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcbp1P60335 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcbp1P60335 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcbp1P60335 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcbp1P60335 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcbp1P60335 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcbp1P60335 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcbp1P60335 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcbp1P60335 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcbp1P60335 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcbp1P60335 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcbp1P60335 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcbp1P60335 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcbp1P60335 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcbp1P60335 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcbp1P60335 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcbp1P60335 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcbp1P60335 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcbp1P60335 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcbp1P60335 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcbp1P60335 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcbp1P60335 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcbp1P60335 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcbp1P60335 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pcbp1P60335 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcbp1P60335 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcbp1P60335 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcbp1P60335 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcbp1P60335 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcbp1P60335 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcbp1P60335 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcbp1P60335 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcbp1P60335 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcbp1P60335 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcbp1P60335 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcbp1P60335 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcbp1P60335 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcbp1P60335 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcbp1P60335 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcbp1P60335 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcbp1P60335 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcbp1P60335 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcbp1P60335 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcbp1P60335 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcbp1P60335 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcbp1P60335 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcbp1P60335 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms