Protein–RNA interactions for Protein: P59913

Pcmtd1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd1P59913 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pcmtd1P59913 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pcmtd1P59913 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pcmtd1P59913 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pcmtd1P59913 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pcmtd1P59913 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pcmtd1P59913 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pcmtd1P59913 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pcmtd1P59913 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pcmtd1P59913 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pcmtd1P59913 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pcmtd1P59913 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pcmtd1P59913 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pcmtd1P59913 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcmtd1P59913 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcmtd1P59913 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcmtd1P59913 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcmtd1P59913 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcmtd1P59913 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcmtd1P59913 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pcmtd1P59913 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pcmtd1P59913 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pcmtd1P59913 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pcmtd1P59913 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Pcmtd1P59913 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pcmtd1P59913 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pcmtd1P59913 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pcmtd1P59913 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pcmtd1P59913 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pcmtd1P59913 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pcmtd1P59913 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pcmtd1P59913 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pcmtd1P59913 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pcmtd1P59913 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pcmtd1P59913 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pcmtd1P59913 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pcmtd1P59913 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pcmtd1P59913 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pcmtd1P59913 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pcmtd1P59913 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pcmtd1P59913 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pcmtd1P59913 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pcmtd1P59913 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pcmtd1P59913 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pcmtd1P59913 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pcmtd1P59913 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pcmtd1P59913 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pcmtd1P59913 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pcmtd1P59913 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pcmtd1P59913 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pcmtd1P59913 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pcmtd1P59913 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pcmtd1P59913 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pcmtd1P59913 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pcmtd1P59913 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pcmtd1P59913 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pcmtd1P59913 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Pcmtd1P59913 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pcmtd1P59913 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pcmtd1P59913 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pcmtd1P59913 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pcmtd1P59913 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pcmtd1P59913 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pcmtd1P59913 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pcmtd1P59913 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pcmtd1P59913 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pcmtd1P59913 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pcmtd1P59913 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pcmtd1P59913 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pcmtd1P59913 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pcmtd1P59913 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pcmtd1P59913 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pcmtd1P59913 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pcmtd1P59913 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Pcmtd1P59913 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pcmtd1P59913 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pcmtd1P59913 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Pcmtd1P59913 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pcmtd1P59913 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pcmtd1P59913 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pcmtd1P59913 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pcmtd1P59913 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pcmtd1P59913 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pcmtd1P59913 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pcmtd1P59913 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pcmtd1P59913 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pcmtd1P59913 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pcmtd1P59913 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcmtd1P59913 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcmtd1P59913 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcmtd1P59913 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcmtd1P59913 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcmtd1P59913 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcmtd1P59913 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcmtd1P59913 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcmtd1P59913 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcmtd1P59913 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pcmtd1P59913 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Pcmtd1P59913 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pcmtd1P59913 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms