Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr3bP59470 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr3bP59470 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr3bP59470 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr3bP59470 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr3bP59470 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr3bP59470 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr3bP59470 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Polr3bP59470 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr3bP59470 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr3bP59470 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr3bP59470 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr3bP59470 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr3bP59470 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr3bP59470 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr3bP59470 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr3bP59470 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr3bP59470 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr3bP59470 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr3bP59470 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr3bP59470 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr3bP59470 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr3bP59470 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr3bP59470 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr3bP59470 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr3bP59470 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr3bP59470 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr3bP59470 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr3bP59470 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr3bP59470 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr3bP59470 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr3bP59470 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr3bP59470 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr3bP59470 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr3bP59470 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr3bP59470 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr3bP59470 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr3bP59470 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr3bP59470 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr3bP59470 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr3bP59470 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr3bP59470 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr3bP59470 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr3bP59470 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr3bP59470 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr3bP59470 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr3bP59470 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr3bP59470 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr3bP59470 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr3bP59470 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr3bP59470 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr3bP59470 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr3bP59470 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr3bP59470 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr3bP59470 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr3bP59470 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr3bP59470 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr3bP59470 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr3bP59470 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr3bP59470 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr3bP59470 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr3bP59470 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr3bP59470 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr3bP59470 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr3bP59470 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr3bP59470 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr3bP59470 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Polr3bP59470 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Polr3bP59470 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Polr3bP59470 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Polr3bP59470 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr3bP59470 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr3bP59470 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr3bP59470 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr3bP59470 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr3bP59470 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr3bP59470 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr3bP59470 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr3bP59470 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr3bP59470 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr3bP59470 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr3bP59470 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr3bP59470 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr3bP59470 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr3bP59470 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr3bP59470 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr3bP59470 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr3bP59470 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Polr3bP59470 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Polr3bP59470 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Polr3bP59470 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Polr3bP59470 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Polr3bP59470 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Polr3bP59470 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Polr3bP59470 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Polr3bP59470 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr3bP59470 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr3bP59470 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr3bP59470 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr3bP59470 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.6 ms