Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hps5P59438 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hps5P59438 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hps5P59438 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Hps5P59438 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hps5P59438 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hps5P59438 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hps5P59438 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Hps5P59438 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Hps5P59438 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hps5P59438 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hps5P59438 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hps5P59438 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hps5P59438 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hps5P59438 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hps5P59438 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hps5P59438 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Hps5P59438 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Hps5P59438 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hps5P59438 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hps5P59438 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hps5P59438 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hps5P59438 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Hps5P59438 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hps5P59438 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hps5P59438 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hps5P59438 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hps5P59438 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hps5P59438 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hps5P59438 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hps5P59438 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hps5P59438 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hps5P59438 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hps5P59438 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hps5P59438 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hps5P59438 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hps5P59438 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hps5P59438 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hps5P59438 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hps5P59438 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hps5P59438 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hps5P59438 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hps5P59438 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hps5P59438 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hps5P59438 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hps5P59438 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hps5P59438 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hps5P59438 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hps5P59438 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hps5P59438 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hps5P59438 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hps5P59438 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hps5P59438 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hps5P59438 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hps5P59438 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hps5P59438 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hps5P59438 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hps5P59438 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hps5P59438 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Hps5P59438 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hps5P59438 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hps5P59438 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hps5P59438 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Hps5P59438 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hps5P59438 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Hps5P59438 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Hps5P59438 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hps5P59438 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hps5P59438 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hps5P59438 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hps5P59438 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hps5P59438 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hps5P59438 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hps5P59438 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hps5P59438 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hps5P59438 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hps5P59438 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hps5P59438 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hps5P59438 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hps5P59438 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hps5P59438 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hps5P59438 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hps5P59438 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hps5P59438 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hps5P59438 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hps5P59438 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Hps5P59438 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hps5P59438 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hps5P59438 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hps5P59438 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hps5P59438 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hps5P59438 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hps5P59438 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hps5P59438 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hps5P59438 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hps5P59438 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hps5P59438 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hps5P59438 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Hps5P59438 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hps5P59438 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms