Protein–RNA interactions for Protein: P58854

Tubgcp3, Gamma-tubulin complex component 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp3P58854 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubgcp3P58854 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubgcp3P58854 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubgcp3P58854 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubgcp3P58854 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubgcp3P58854 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubgcp3P58854 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubgcp3P58854 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubgcp3P58854 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubgcp3P58854 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubgcp3P58854 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubgcp3P58854 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubgcp3P58854 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubgcp3P58854 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubgcp3P58854 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubgcp3P58854 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubgcp3P58854 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubgcp3P58854 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubgcp3P58854 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubgcp3P58854 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubgcp3P58854 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubgcp3P58854 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tubgcp3P58854 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tubgcp3P58854 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tubgcp3P58854 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tubgcp3P58854 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubgcp3P58854 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubgcp3P58854 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubgcp3P58854 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubgcp3P58854 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubgcp3P58854 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubgcp3P58854 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubgcp3P58854 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubgcp3P58854 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubgcp3P58854 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubgcp3P58854 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubgcp3P58854 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubgcp3P58854 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubgcp3P58854 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubgcp3P58854 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubgcp3P58854 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubgcp3P58854 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubgcp3P58854 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubgcp3P58854 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubgcp3P58854 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubgcp3P58854 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubgcp3P58854 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubgcp3P58854 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubgcp3P58854 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubgcp3P58854 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubgcp3P58854 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubgcp3P58854 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubgcp3P58854 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubgcp3P58854 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubgcp3P58854 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubgcp3P58854 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubgcp3P58854 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubgcp3P58854 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubgcp3P58854 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubgcp3P58854 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tubgcp3P58854 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tubgcp3P58854 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubgcp3P58854 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubgcp3P58854 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubgcp3P58854 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubgcp3P58854 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubgcp3P58854 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubgcp3P58854 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubgcp3P58854 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubgcp3P58854 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubgcp3P58854 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubgcp3P58854 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubgcp3P58854 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubgcp3P58854 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubgcp3P58854 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubgcp3P58854 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubgcp3P58854 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubgcp3P58854 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubgcp3P58854 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubgcp3P58854 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubgcp3P58854 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubgcp3P58854 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubgcp3P58854 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubgcp3P58854 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tubgcp3P58854 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tubgcp3P58854 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubgcp3P58854 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubgcp3P58854 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubgcp3P58854 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubgcp3P58854 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubgcp3P58854 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubgcp3P58854 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubgcp3P58854 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubgcp3P58854 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubgcp3P58854 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubgcp3P58854 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubgcp3P58854 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubgcp3P58854 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubgcp3P58854 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubgcp3P58854 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms