Protein–RNA interactions for Protein: P58281

Opa1, Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa1P58281 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Opa1P58281 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Opa1P58281 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Opa1P58281 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Opa1P58281 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Opa1P58281 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Opa1P58281 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Opa1P58281 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Opa1P58281 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Opa1P58281 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Opa1P58281 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Opa1P58281 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Opa1P58281 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Opa1P58281 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Opa1P58281 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Opa1P58281 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Opa1P58281 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Opa1P58281 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Opa1P58281 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Opa1P58281 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Opa1P58281 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Opa1P58281 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Opa1P58281 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Opa1P58281 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Opa1P58281 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Opa1P58281 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Opa1P58281 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Opa1P58281 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Opa1P58281 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Opa1P58281 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Opa1P58281 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Opa1P58281 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Opa1P58281 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Opa1P58281 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Opa1P58281 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Opa1P58281 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Opa1P58281 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Opa1P58281 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Opa1P58281 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Opa1P58281 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Opa1P58281 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Opa1P58281 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Opa1P58281 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Opa1P58281 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Opa1P58281 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Opa1P58281 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Opa1P58281 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Opa1P58281 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Opa1P58281 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Opa1P58281 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Opa1P58281 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Opa1P58281 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Opa1P58281 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Opa1P58281 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Opa1P58281 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Opa1P58281 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Opa1P58281 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Opa1P58281 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Opa1P58281 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Opa1P58281 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Opa1P58281 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Opa1P58281 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Opa1P58281 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Opa1P58281 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Opa1P58281 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Opa1P58281 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Opa1P58281 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Opa1P58281 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Opa1P58281 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Opa1P58281 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Opa1P58281 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Opa1P58281 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Opa1P58281 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Opa1P58281 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Opa1P58281 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Opa1P58281 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Opa1P58281 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Opa1P58281 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Opa1P58281 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Opa1P58281 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Opa1P58281 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Opa1P58281 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Opa1P58281 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Opa1P58281 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Opa1P58281 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Opa1P58281 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Opa1P58281 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Opa1P58281 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Opa1P58281 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Opa1P58281 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Opa1P58281 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Opa1P58281 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Opa1P58281 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Opa1P58281 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Opa1P58281 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Opa1P58281 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Opa1P58281 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Opa1P58281 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Opa1P58281 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Opa1P58281 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms