Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cd38P56528 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cd38P56528 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cd38P56528 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cd38P56528 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cd38P56528 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cd38P56528 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cd38P56528 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cd38P56528 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cd38P56528 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cd38P56528 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cd38P56528 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cd38P56528 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cd38P56528 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Cd38P56528 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cd38P56528 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cd38P56528 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cd38P56528 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cd38P56528 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cd38P56528 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cd38P56528 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cd38P56528 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cd38P56528 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cd38P56528 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cd38P56528 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cd38P56528 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cd38P56528 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cd38P56528 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cd38P56528 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cd38P56528 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cd38P56528 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cd38P56528 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cd38P56528 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cd38P56528 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cd38P56528 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cd38P56528 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cd38P56528 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Cd38P56528 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Cd38P56528 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cd38P56528 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cd38P56528 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cd38P56528 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cd38P56528 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cd38P56528 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cd38P56528 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cd38P56528 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cd38P56528 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cd38P56528 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Cd38P56528 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cd38P56528 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cd38P56528 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cd38P56528 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cd38P56528 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cd38P56528 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cd38P56528 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cd38P56528 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cd38P56528 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cd38P56528 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cd38P56528 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cd38P56528 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cd38P56528 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cd38P56528 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cd38P56528 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cd38P56528 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cd38P56528 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cd38P56528 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cd38P56528 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cd38P56528 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Cd38P56528 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cd38P56528 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cd38P56528 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cd38P56528 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cd38P56528 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cd38P56528 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cd38P56528 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cd38P56528 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cd38P56528 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cd38P56528 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cd38P56528 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cd38P56528 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cd38P56528 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cd38P56528 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cd38P56528 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cd38P56528 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cd38P56528 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cd38P56528 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cd38P56528 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cd38P56528 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Cd38P56528 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cd38P56528 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cd38P56528 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cd38P56528 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cd38P56528 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cd38P56528 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cd38P56528 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cd38P56528 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cd38P56528 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cd38P56528 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cd38P56528 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cd38P56528 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms